Protein–RNA interactions for Protein: Q16540

MRPL23, 39S ribosomal protein L23, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 153 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL23Q16540 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MRPL23Q16540 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MRPL23Q16540 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MRPL23Q16540 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MRPL23Q16540 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MRPL23Q16540 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MRPL23Q16540 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MRPL23Q16540 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
MRPL23Q16540 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MRPL23Q16540 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
MRPL23Q16540 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
MRPL23Q16540 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MRPL23Q16540 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
MRPL23Q16540 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MRPL23Q16540 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MRPL23Q16540 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MRPL23Q16540 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MRPL23Q16540 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MRPL23Q16540 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MRPL23Q16540 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MRPL23Q16540 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MRPL23Q16540 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MRPL23Q16540 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MRPL23Q16540 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MRPL23Q16540 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MRPL23Q16540 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MRPL23Q16540 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MRPL23Q16540 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MRPL23Q16540 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MRPL23Q16540 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MRPL23Q16540 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MRPL23Q16540 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MRPL23Q16540 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MRPL23Q16540 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MRPL23Q16540 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MRPL23Q16540 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MRPL23Q16540 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MRPL23Q16540 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MRPL23Q16540 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MRPL23Q16540 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MRPL23Q16540 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MRPL23Q16540 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MRPL23Q16540 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MRPL23Q16540 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MRPL23Q16540 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MRPL23Q16540 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MRPL23Q16540 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MRPL23Q16540 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MRPL23Q16540 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MRPL23Q16540 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MRPL23Q16540 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MRPL23Q16540 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MRPL23Q16540 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MRPL23Q16540 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MRPL23Q16540 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MRPL23Q16540 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MRPL23Q16540 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MRPL23Q16540 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MRPL23Q16540 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MRPL23Q16540 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MRPL23Q16540 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MRPL23Q16540 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MRPL23Q16540 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MRPL23Q16540 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MRPL23Q16540 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MRPL23Q16540 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MRPL23Q16540 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MRPL23Q16540 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MRPL23Q16540 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MRPL23Q16540 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MRPL23Q16540 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MRPL23Q16540 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MRPL23Q16540 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MRPL23Q16540 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MRPL23Q16540 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
MRPL23Q16540 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MRPL23Q16540 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MRPL23Q16540 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MRPL23Q16540 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MRPL23Q16540 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MRPL23Q16540 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MRPL23Q16540 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MRPL23Q16540 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MRPL23Q16540 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MRPL23Q16540 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MRPL23Q16540 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
MRPL23Q16540 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MRPL23Q16540 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MRPL23Q16540 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MRPL23Q16540 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MRPL23Q16540 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MRPL23Q16540 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MRPL23Q16540 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MRPL23Q16540 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MRPL23Q16540 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MRPL23Q16540 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MRPL23Q16540 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MRPL23Q16540 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MRPL23Q16540 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MRPL23Q16540 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
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