Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
DDB1Q16531 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
DDB1Q16531 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
DDB1Q16531 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
DDB1Q16531 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
DDB1Q16531 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
DDB1Q16531 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
DDB1Q16531 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
DDB1Q16531 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
DDB1Q16531 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
DDB1Q16531 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
DDB1Q16531 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
DDB1Q16531 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC31.5■■■□□ 2.63
DDB1Q16531 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
DDB1Q16531 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
DDB1Q16531 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
DDB1Q16531 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
DDB1Q16531 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
DDB1Q16531 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
DDB1Q16531 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
DDB1Q16531 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
DDB1Q16531 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
DDB1Q16531 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
DDB1Q16531 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
DDB1Q16531 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC31.48■■■□□ 2.63
DDB1Q16531 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
DDB1Q16531 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
DDB1Q16531 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
DDB1Q16531 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC31.47■■■□□ 2.63
DDB1Q16531 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
DDB1Q16531 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
DDB1Q16531 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
DDB1Q16531 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
DDB1Q16531 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
DDB1Q16531 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
DDB1Q16531 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
DDB1Q16531 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
DDB1Q16531 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
DDB1Q16531 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
DDB1Q16531 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
DDB1Q16531 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
DDB1Q16531 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
DDB1Q16531 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
DDB1Q16531 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
DDB1Q16531 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
DDB1Q16531 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
DDB1Q16531 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
DDB1Q16531 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
DDB1Q16531 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
DDB1Q16531 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
DDB1Q16531 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
DDB1Q16531 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
DDB1Q16531 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
DDB1Q16531 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
DDB1Q16531 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
DDB1Q16531 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
DDB1Q16531 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
DDB1Q16531 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
DDB1Q16531 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
DDB1Q16531 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC31.39■■■□□ 2.62
DDB1Q16531 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC31.39■■■□□ 2.62
DDB1Q16531 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC31.39■■■□□ 2.62
DDB1Q16531 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
DDB1Q16531 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
DDB1Q16531 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
DDB1Q16531 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
DDB1Q16531 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
DDB1Q16531 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
DDB1Q16531 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
DDB1Q16531 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
DDB1Q16531 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
DDB1Q16531 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
DDB1Q16531 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
DDB1Q16531 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
DDB1Q16531 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
DDB1Q16531 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
DDB1Q16531 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
DDB1Q16531 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
DDB1Q16531 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
DDB1Q16531 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
DDB1Q16531 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
DDB1Q16531 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
DDB1Q16531 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC31.36■■■□□ 2.61
DDB1Q16531 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
DDB1Q16531 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
DDB1Q16531 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
DDB1Q16531 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
DDB1Q16531 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
DDB1Q16531 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
DDB1Q16531 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
DDB1Q16531 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
DDB1Q16531 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC31.33■■■□□ 2.61
DDB1Q16531 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
DDB1Q16531 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
DDB1Q16531 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
DDB1Q16531 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
DDB1Q16531 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
DDB1Q16531 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
DDB1Q16531 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
DDB1Q16531 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC31.31■■■□□ 2.6
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