Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NPTX1Q15818 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
NPTX1Q15818 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NPTX1Q15818 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NPTX1Q15818 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NPTX1Q15818 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NPTX1Q15818 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NPTX1Q15818 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NPTX1Q15818 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPTX1Q15818 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPTX1Q15818 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPTX1Q15818 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPTX1Q15818 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPTX1Q15818 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPTX1Q15818 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPTX1Q15818 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPTX1Q15818 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPTX1Q15818 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPTX1Q15818 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NPTX1Q15818 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NPTX1Q15818 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NPTX1Q15818 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NPTX1Q15818 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NPTX1Q15818 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NPTX1Q15818 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NPTX1Q15818 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NPTX1Q15818 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPTX1Q15818 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPTX1Q15818 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPTX1Q15818 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPTX1Q15818 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPTX1Q15818 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPTX1Q15818 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NPTX1Q15818 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPTX1Q15818 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPTX1Q15818 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPTX1Q15818 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPTX1Q15818 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPTX1Q15818 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPTX1Q15818 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPTX1Q15818 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPTX1Q15818 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NPTX1Q15818 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NPTX1Q15818 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NPTX1Q15818 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NPTX1Q15818 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NPTX1Q15818 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NPTX1Q15818 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NPTX1Q15818 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NPTX1Q15818 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NPTX1Q15818 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NPTX1Q15818 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NPTX1Q15818 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NPTX1Q15818 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NPTX1Q15818 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NPTX1Q15818 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NPTX1Q15818 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NPTX1Q15818 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NPTX1Q15818 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NPTX1Q15818 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NPTX1Q15818 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NPTX1Q15818 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NPTX1Q15818 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NPTX1Q15818 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NPTX1Q15818 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NPTX1Q15818 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NPTX1Q15818 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NPTX1Q15818 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NPTX1Q15818 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NPTX1Q15818 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NPTX1Q15818 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NPTX1Q15818 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NPTX1Q15818 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NPTX1Q15818 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NPTX1Q15818 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NPTX1Q15818 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NPTX1Q15818 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NPTX1Q15818 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NPTX1Q15818 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NPTX1Q15818 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NPTX1Q15818 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NPTX1Q15818 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NPTX1Q15818 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NPTX1Q15818 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NPTX1Q15818 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NPTX1Q15818 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NPTX1Q15818 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NPTX1Q15818 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NPTX1Q15818 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NPTX1Q15818 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NPTX1Q15818 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NPTX1Q15818 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NPTX1Q15818 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NPTX1Q15818 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NPTX1Q15818 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NPTX1Q15818 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NPTX1Q15818 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NPTX1Q15818 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NPTX1Q15818 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NPTX1Q15818 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms