Protein–RNA interactions for Protein: Q15583

TGIF1, Homeobox protein TGIF1, humanhuman

Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGIF1Q15583 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TGIF1Q15583 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TGIF1Q15583 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TGIF1Q15583 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TGIF1Q15583 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TGIF1Q15583 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TGIF1Q15583 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TGIF1Q15583 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TGIF1Q15583 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TGIF1Q15583 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TGIF1Q15583 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TGIF1Q15583 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TGIF1Q15583 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TGIF1Q15583 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TGIF1Q15583 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TGIF1Q15583 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TGIF1Q15583 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TGIF1Q15583 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TGIF1Q15583 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TGIF1Q15583 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TGIF1Q15583 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TGIF1Q15583 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TGIF1Q15583 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TGIF1Q15583 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TGIF1Q15583 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TGIF1Q15583 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TGIF1Q15583 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TGIF1Q15583 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TGIF1Q15583 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TGIF1Q15583 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TGIF1Q15583 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TGIF1Q15583 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TGIF1Q15583 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TGIF1Q15583 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TGIF1Q15583 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TGIF1Q15583 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TGIF1Q15583 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TGIF1Q15583 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TGIF1Q15583 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TGIF1Q15583 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TGIF1Q15583 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TGIF1Q15583 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TGIF1Q15583 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TGIF1Q15583 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TGIF1Q15583 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TGIF1Q15583 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TGIF1Q15583 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TGIF1Q15583 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TGIF1Q15583 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TGIF1Q15583 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TGIF1Q15583 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TGIF1Q15583 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TGIF1Q15583 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TGIF1Q15583 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TGIF1Q15583 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TGIF1Q15583 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TGIF1Q15583 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TGIF1Q15583 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TGIF1Q15583 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TGIF1Q15583 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TGIF1Q15583 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TGIF1Q15583 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TGIF1Q15583 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TGIF1Q15583 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TGIF1Q15583 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TGIF1Q15583 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TGIF1Q15583 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TGIF1Q15583 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TGIF1Q15583 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TGIF1Q15583 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TGIF1Q15583 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TGIF1Q15583 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TGIF1Q15583 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TGIF1Q15583 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TGIF1Q15583 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TGIF1Q15583 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TGIF1Q15583 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TGIF1Q15583 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TGIF1Q15583 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TGIF1Q15583 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TGIF1Q15583 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TGIF1Q15583 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TGIF1Q15583 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TGIF1Q15583 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TGIF1Q15583 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TGIF1Q15583 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TGIF1Q15583 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TGIF1Q15583 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TGIF1Q15583 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TGIF1Q15583 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TGIF1Q15583 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TGIF1Q15583 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TGIF1Q15583 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TGIF1Q15583 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TGIF1Q15583 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TGIF1Q15583 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TGIF1Q15583 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TGIF1Q15583 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TGIF1Q15583 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TGIF1Q15583 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms