Protein–RNA interactions for Protein: Q15428

SF3A2, Splicing factor 3A subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3A2Q15428 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SF3A2Q15428 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SF3A2Q15428 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SF3A2Q15428 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SF3A2Q15428 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SF3A2Q15428 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SF3A2Q15428 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SF3A2Q15428 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SF3A2Q15428 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SF3A2Q15428 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SF3A2Q15428 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SF3A2Q15428 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SF3A2Q15428 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SF3A2Q15428 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SF3A2Q15428 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SF3A2Q15428 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SF3A2Q15428 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SF3A2Q15428 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SF3A2Q15428 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SF3A2Q15428 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SF3A2Q15428 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SF3A2Q15428 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SF3A2Q15428 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SF3A2Q15428 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SF3A2Q15428 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SF3A2Q15428 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SF3A2Q15428 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SF3A2Q15428 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SF3A2Q15428 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SF3A2Q15428 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SF3A2Q15428 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SF3A2Q15428 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SF3A2Q15428 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SF3A2Q15428 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SF3A2Q15428 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SF3A2Q15428 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SF3A2Q15428 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SF3A2Q15428 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SF3A2Q15428 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SF3A2Q15428 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SF3A2Q15428 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SF3A2Q15428 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SF3A2Q15428 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SF3A2Q15428 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SF3A2Q15428 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SF3A2Q15428 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SF3A2Q15428 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SF3A2Q15428 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SF3A2Q15428 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SF3A2Q15428 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SF3A2Q15428 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SF3A2Q15428 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SF3A2Q15428 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SF3A2Q15428 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SF3A2Q15428 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SF3A2Q15428 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SF3A2Q15428 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SF3A2Q15428 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SF3A2Q15428 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SF3A2Q15428 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SF3A2Q15428 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SF3A2Q15428 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SF3A2Q15428 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SF3A2Q15428 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SF3A2Q15428 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SF3A2Q15428 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SF3A2Q15428 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SF3A2Q15428 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SF3A2Q15428 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SF3A2Q15428 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SF3A2Q15428 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SF3A2Q15428 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SF3A2Q15428 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SF3A2Q15428 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SF3A2Q15428 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SF3A2Q15428 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SF3A2Q15428 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SF3A2Q15428 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SF3A2Q15428 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SF3A2Q15428 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SF3A2Q15428 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SF3A2Q15428 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SF3A2Q15428 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SF3A2Q15428 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SF3A2Q15428 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SF3A2Q15428 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SF3A2Q15428 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SF3A2Q15428 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SF3A2Q15428 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SF3A2Q15428 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SF3A2Q15428 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SF3A2Q15428 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SF3A2Q15428 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SF3A2Q15428 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SF3A2Q15428 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SF3A2Q15428 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SF3A2Q15428 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SF3A2Q15428 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SF3A2Q15428 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SF3A2Q15428 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
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