Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HERPUD1Q15011 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HERPUD1Q15011 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HERPUD1Q15011 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HERPUD1Q15011 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HERPUD1Q15011 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HERPUD1Q15011 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HERPUD1Q15011 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HERPUD1Q15011 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HERPUD1Q15011 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HERPUD1Q15011 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HERPUD1Q15011 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HERPUD1Q15011 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
HERPUD1Q15011 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HERPUD1Q15011 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
HERPUD1Q15011 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
HERPUD1Q15011 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HERPUD1Q15011 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HERPUD1Q15011 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HERPUD1Q15011 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HERPUD1Q15011 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HERPUD1Q15011 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HERPUD1Q15011 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HERPUD1Q15011 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HERPUD1Q15011 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HERPUD1Q15011 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HERPUD1Q15011 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HERPUD1Q15011 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HERPUD1Q15011 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HERPUD1Q15011 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HERPUD1Q15011 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HERPUD1Q15011 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HERPUD1Q15011 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HERPUD1Q15011 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HERPUD1Q15011 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HERPUD1Q15011 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HERPUD1Q15011 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HERPUD1Q15011 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HERPUD1Q15011 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HERPUD1Q15011 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HERPUD1Q15011 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HERPUD1Q15011 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HERPUD1Q15011 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HERPUD1Q15011 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HERPUD1Q15011 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HERPUD1Q15011 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HERPUD1Q15011 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HERPUD1Q15011 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HERPUD1Q15011 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HERPUD1Q15011 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HERPUD1Q15011 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HERPUD1Q15011 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HERPUD1Q15011 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HERPUD1Q15011 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HERPUD1Q15011 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
HERPUD1Q15011 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HERPUD1Q15011 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HERPUD1Q15011 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HERPUD1Q15011 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HERPUD1Q15011 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HERPUD1Q15011 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HERPUD1Q15011 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HERPUD1Q15011 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HERPUD1Q15011 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HERPUD1Q15011 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HERPUD1Q15011 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HERPUD1Q15011 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
HERPUD1Q15011 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HERPUD1Q15011 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HERPUD1Q15011 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HERPUD1Q15011 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HERPUD1Q15011 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HERPUD1Q15011 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HERPUD1Q15011 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
HERPUD1Q15011 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HERPUD1Q15011 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HERPUD1Q15011 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HERPUD1Q15011 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HERPUD1Q15011 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
HERPUD1Q15011 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HERPUD1Q15011 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
HERPUD1Q15011 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HERPUD1Q15011 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HERPUD1Q15011 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HERPUD1Q15011 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
HERPUD1Q15011 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HERPUD1Q15011 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HERPUD1Q15011 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HERPUD1Q15011 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HERPUD1Q15011 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HERPUD1Q15011 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HERPUD1Q15011 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HERPUD1Q15011 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HERPUD1Q15011 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HERPUD1Q15011 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
HERPUD1Q15011 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HERPUD1Q15011 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HERPUD1Q15011 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
HERPUD1Q15011 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HERPUD1Q15011 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
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