Protein–RNA interactions for Protein: Q13492

PICALM, Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein, humanhuman

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Length 652 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PICALMQ13492 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PICALMQ13492 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PICALMQ13492 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PICALMQ13492 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PICALMQ13492 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PICALMQ13492 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PICALMQ13492 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PICALMQ13492 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PICALMQ13492 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PICALMQ13492 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PICALMQ13492 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PICALMQ13492 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PICALMQ13492 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
PICALMQ13492 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PICALMQ13492 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PICALMQ13492 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PICALMQ13492 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PICALMQ13492 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PICALMQ13492 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PICALMQ13492 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PICALMQ13492 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PICALMQ13492 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PICALMQ13492 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PICALMQ13492 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PICALMQ13492 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PICALMQ13492 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PICALMQ13492 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
PICALMQ13492 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
PICALMQ13492 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PICALMQ13492 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PICALMQ13492 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PICALMQ13492 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PICALMQ13492 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PICALMQ13492 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PICALMQ13492 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PICALMQ13492 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
PICALMQ13492 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
PICALMQ13492 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PICALMQ13492 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PICALMQ13492 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PICALMQ13492 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PICALMQ13492 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PICALMQ13492 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PICALMQ13492 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PICALMQ13492 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
PICALMQ13492 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PICALMQ13492 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PICALMQ13492 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PICALMQ13492 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PICALMQ13492 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PICALMQ13492 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PICALMQ13492 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PICALMQ13492 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PICALMQ13492 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PICALMQ13492 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PICALMQ13492 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PICALMQ13492 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
PICALMQ13492 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PICALMQ13492 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PICALMQ13492 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PICALMQ13492 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PICALMQ13492 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PICALMQ13492 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
PICALMQ13492 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PICALMQ13492 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PICALMQ13492 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
PICALMQ13492 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PICALMQ13492 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PICALMQ13492 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PICALMQ13492 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PICALMQ13492 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PICALMQ13492 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PICALMQ13492 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PICALMQ13492 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PICALMQ13492 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PICALMQ13492 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PICALMQ13492 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PICALMQ13492 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PICALMQ13492 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PICALMQ13492 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PICALMQ13492 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PICALMQ13492 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PICALMQ13492 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PICALMQ13492 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PICALMQ13492 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PICALMQ13492 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
PICALMQ13492 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PICALMQ13492 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PICALMQ13492 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PICALMQ13492 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PICALMQ13492 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PICALMQ13492 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PICALMQ13492 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PICALMQ13492 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PICALMQ13492 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
PICALMQ13492 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PICALMQ13492 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PICALMQ13492 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PICALMQ13492 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PICALMQ13492 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
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