Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC173Q0VFZ6 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC173Q0VFZ6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC173Q0VFZ6 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC173Q0VFZ6 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC173Q0VFZ6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC173Q0VFZ6 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC173Q0VFZ6 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC173Q0VFZ6 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC173Q0VFZ6 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC173Q0VFZ6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC173Q0VFZ6 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC173Q0VFZ6 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC173Q0VFZ6 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC173Q0VFZ6 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC173Q0VFZ6 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC173Q0VFZ6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC173Q0VFZ6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC173Q0VFZ6 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC173Q0VFZ6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC173Q0VFZ6 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC173Q0VFZ6 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC173Q0VFZ6 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC173Q0VFZ6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC173Q0VFZ6 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC173Q0VFZ6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC173Q0VFZ6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC173Q0VFZ6 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC173Q0VFZ6 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC173Q0VFZ6 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC173Q0VFZ6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC173Q0VFZ6 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC173Q0VFZ6 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC173Q0VFZ6 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC173Q0VFZ6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC173Q0VFZ6 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC173Q0VFZ6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC173Q0VFZ6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC173Q0VFZ6 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC173Q0VFZ6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC173Q0VFZ6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC173Q0VFZ6 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC173Q0VFZ6 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC173Q0VFZ6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC173Q0VFZ6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC173Q0VFZ6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC173Q0VFZ6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC173Q0VFZ6 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC173Q0VFZ6 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC173Q0VFZ6 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC173Q0VFZ6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC173Q0VFZ6 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC173Q0VFZ6 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC173Q0VFZ6 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC173Q0VFZ6 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC173Q0VFZ6 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC173Q0VFZ6 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC173Q0VFZ6 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC173Q0VFZ6 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC173Q0VFZ6 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC173Q0VFZ6 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC173Q0VFZ6 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC173Q0VFZ6 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC173Q0VFZ6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC173Q0VFZ6 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC173Q0VFZ6 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC173Q0VFZ6 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC173Q0VFZ6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC173Q0VFZ6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC173Q0VFZ6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC173Q0VFZ6 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CCDC173Q0VFZ6 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC173Q0VFZ6 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC173Q0VFZ6 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC173Q0VFZ6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC173Q0VFZ6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC173Q0VFZ6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC173Q0VFZ6 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC173Q0VFZ6 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC173Q0VFZ6 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC173Q0VFZ6 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC173Q0VFZ6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC173Q0VFZ6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC173Q0VFZ6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC173Q0VFZ6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC173Q0VFZ6 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC173Q0VFZ6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC173Q0VFZ6 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC173Q0VFZ6 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC173Q0VFZ6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC173Q0VFZ6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC173Q0VFZ6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC173Q0VFZ6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC173Q0VFZ6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC173Q0VFZ6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC173Q0VFZ6 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC173Q0VFZ6 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC173Q0VFZ6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC173Q0VFZ6 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC173Q0VFZ6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms