Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFX4

Putative uncharacterized protein LOC100128554, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q0VFX4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q0VFX4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q0VFX4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q0VFX4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q0VFX4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Q0VFX4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Q0VFX4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q0VFX4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q0VFX4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q0VFX4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q0VFX4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q0VFX4 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q0VFX4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Q0VFX4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Q0VFX4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q0VFX4 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q0VFX4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Q0VFX4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Q0VFX4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q0VFX4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q0VFX4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Q0VFX4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q0VFX4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q0VFX4 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Q0VFX4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q0VFX4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q0VFX4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q0VFX4 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q0VFX4 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q0VFX4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q0VFX4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q0VFX4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q0VFX4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q0VFX4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Q0VFX4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q0VFX4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q0VFX4 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q0VFX4 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q0VFX4 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Q0VFX4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Q0VFX4 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q0VFX4 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q0VFX4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q0VFX4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q0VFX4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q0VFX4 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q0VFX4 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q0VFX4 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q0VFX4 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q0VFX4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q0VFX4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q0VFX4 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Q0VFX4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q0VFX4 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q0VFX4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q0VFX4 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q0VFX4 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Q0VFX4 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q0VFX4 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q0VFX4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q0VFX4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q0VFX4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q0VFX4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q0VFX4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Q0VFX4 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Q0VFX4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q0VFX4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q0VFX4 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q0VFX4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Q0VFX4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q0VFX4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q0VFX4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q0VFX4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q0VFX4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q0VFX4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q0VFX4 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q0VFX4 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q0VFX4 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q0VFX4 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q0VFX4 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q0VFX4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q0VFX4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q0VFX4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q0VFX4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q0VFX4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q0VFX4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q0VFX4 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q0VFX4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q0VFX4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q0VFX4 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q0VFX4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q0VFX4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q0VFX4 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q0VFX4 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q0VFX4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q0VFX4 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q0VFX4 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q0VFX4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Q0VFX4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q0VFX4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms