Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC38.99■■■■□ 3.83
GOLGA3Q08378 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
GOLGA3Q08378 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.99■■■■□ 3.83
GOLGA3Q08378 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC38.98■■■■□ 3.83
GOLGA3Q08378 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
GOLGA3Q08378 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
GOLGA3Q08378 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
GOLGA3Q08378 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
GOLGA3Q08378 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC38.98■■■■□ 3.83
GOLGA3Q08378 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC38.98■■■■□ 3.83
GOLGA3Q08378 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
GOLGA3Q08378 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
GOLGA3Q08378 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
GOLGA3Q08378 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC38.98■■■■□ 3.83
GOLGA3Q08378 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC38.98■■■■□ 3.83
GOLGA3Q08378 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC38.97■■■■□ 3.83
GOLGA3Q08378 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
GOLGA3Q08378 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
GOLGA3Q08378 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC38.96■■■■□ 3.83
GOLGA3Q08378 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC38.96■■■■□ 3.83
GOLGA3Q08378 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
GOLGA3Q08378 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
GOLGA3Q08378 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
GOLGA3Q08378 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC38.95■■■■□ 3.83
GOLGA3Q08378 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC38.95■■■■□ 3.83
GOLGA3Q08378 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC38.95■■■■□ 3.83
GOLGA3Q08378 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
GOLGA3Q08378 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
GOLGA3Q08378 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC38.95■■■■□ 3.83
GOLGA3Q08378 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.94■■■■□ 3.82
GOLGA3Q08378 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC38.93■■■■□ 3.82
GOLGA3Q08378 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC38.93■■■■□ 3.82
GOLGA3Q08378 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC38.93■■■■□ 3.82
GOLGA3Q08378 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
GOLGA3Q08378 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
GOLGA3Q08378 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC38.93■■■■□ 3.82
GOLGA3Q08378 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
GOLGA3Q08378 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC38.93■■■■□ 3.82
GOLGA3Q08378 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC38.92■■■■□ 3.82
GOLGA3Q08378 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
GOLGA3Q08378 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC38.92■■■■□ 3.82
GOLGA3Q08378 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
GOLGA3Q08378 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
GOLGA3Q08378 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC38.92■■■■□ 3.82
GOLGA3Q08378 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
GOLGA3Q08378 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
GOLGA3Q08378 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC38.91■■■■□ 3.82
GOLGA3Q08378 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
GOLGA3Q08378 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
GOLGA3Q08378 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC38.9■■■■□ 3.82
GOLGA3Q08378 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
GOLGA3Q08378 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.9■■■■□ 3.82
GOLGA3Q08378 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC38.9■■■■□ 3.82
GOLGA3Q08378 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.9■■■■□ 3.82
GOLGA3Q08378 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC38.9■■■■□ 3.82
GOLGA3Q08378 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
GOLGA3Q08378 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.9■■■■□ 3.82
GOLGA3Q08378 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
GOLGA3Q08378 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
GOLGA3Q08378 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC38.88■■■■□ 3.82
GOLGA3Q08378 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC38.88■■■■□ 3.81
GOLGA3Q08378 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC38.88■■■■□ 3.81
GOLGA3Q08378 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
GOLGA3Q08378 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC38.88■■■■□ 3.81
GOLGA3Q08378 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
GOLGA3Q08378 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC38.87■■■■□ 3.81
GOLGA3Q08378 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC38.87■■■■□ 3.81
GOLGA3Q08378 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC38.87■■■■□ 3.81
GOLGA3Q08378 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
GOLGA3Q08378 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC38.87■■■■□ 3.81
GOLGA3Q08378 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC38.87■■■■□ 3.81
GOLGA3Q08378 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
GOLGA3Q08378 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
GOLGA3Q08378 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC38.86■■■■□ 3.81
GOLGA3Q08378 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC38.86■■■■□ 3.81
GOLGA3Q08378 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC38.86■■■■□ 3.81
GOLGA3Q08378 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
GOLGA3Q08378 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
GOLGA3Q08378 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC38.85■■■■□ 3.81
GOLGA3Q08378 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
GOLGA3Q08378 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
GOLGA3Q08378 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
GOLGA3Q08378 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.84■■■■□ 3.81
GOLGA3Q08378 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC38.84■■■■□ 3.81
GOLGA3Q08378 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
GOLGA3Q08378 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.84■■■■□ 3.81
GOLGA3Q08378 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
GOLGA3Q08378 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC38.83■■■■□ 3.81
GOLGA3Q08378 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
GOLGA3Q08378 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.83■■■■□ 3.81
GOLGA3Q08378 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC38.83■■■■□ 3.81
GOLGA3Q08378 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.81
GOLGA3Q08378 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC38.82■■■■□ 3.81
GOLGA3Q08378 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.82■■■■□ 3.8
GOLGA3Q08378 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.8
GOLGA3Q08378 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC38.81■■■■□ 3.8
GOLGA3Q08378 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC38.81■■■■□ 3.8
GOLGA3Q08378 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.8■■■■□ 3.8
GOLGA3Q08378 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
GOLGA3Q08378 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms