Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DSG1Q02413 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DSG1Q02413 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DSG1Q02413 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DSG1Q02413 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DSG1Q02413 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DSG1Q02413 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DSG1Q02413 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DSG1Q02413 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DSG1Q02413 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DSG1Q02413 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DSG1Q02413 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DSG1Q02413 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DSG1Q02413 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DSG1Q02413 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DSG1Q02413 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DSG1Q02413 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DSG1Q02413 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DSG1Q02413 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DSG1Q02413 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DSG1Q02413 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DSG1Q02413 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DSG1Q02413 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
DSG1Q02413 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DSG1Q02413 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DSG1Q02413 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DSG1Q02413 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DSG1Q02413 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DSG1Q02413 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DSG1Q02413 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DSG1Q02413 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DSG1Q02413 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DSG1Q02413 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DSG1Q02413 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DSG1Q02413 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DSG1Q02413 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DSG1Q02413 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DSG1Q02413 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
DSG1Q02413 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DSG1Q02413 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DSG1Q02413 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DSG1Q02413 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DSG1Q02413 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DSG1Q02413 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DSG1Q02413 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DSG1Q02413 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DSG1Q02413 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DSG1Q02413 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DSG1Q02413 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
DSG1Q02413 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
DSG1Q02413 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
DSG1Q02413 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
DSG1Q02413 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
DSG1Q02413 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DSG1Q02413 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DSG1Q02413 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DSG1Q02413 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DSG1Q02413 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DSG1Q02413 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
DSG1Q02413 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DSG1Q02413 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DSG1Q02413 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
DSG1Q02413 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DSG1Q02413 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DSG1Q02413 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DSG1Q02413 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
DSG1Q02413 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DSG1Q02413 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DSG1Q02413 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DSG1Q02413 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DSG1Q02413 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DSG1Q02413 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DSG1Q02413 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DSG1Q02413 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DSG1Q02413 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DSG1Q02413 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
DSG1Q02413 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DSG1Q02413 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DSG1Q02413 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DSG1Q02413 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DSG1Q02413 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DSG1Q02413 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
DSG1Q02413 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DSG1Q02413 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DSG1Q02413 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DSG1Q02413 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DSG1Q02413 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DSG1Q02413 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DSG1Q02413 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DSG1Q02413 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DSG1Q02413 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DSG1Q02413 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
DSG1Q02413 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
DSG1Q02413 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DSG1Q02413 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
DSG1Q02413 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DSG1Q02413 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DSG1Q02413 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DSG1Q02413 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DSG1Q02413 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 153.9 ms