Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BNC1Q01954 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BNC1Q01954 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BNC1Q01954 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
BNC1Q01954 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BNC1Q01954 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BNC1Q01954 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BNC1Q01954 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BNC1Q01954 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BNC1Q01954 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BNC1Q01954 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BNC1Q01954 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BNC1Q01954 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
BNC1Q01954 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BNC1Q01954 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BNC1Q01954 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BNC1Q01954 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BNC1Q01954 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BNC1Q01954 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BNC1Q01954 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BNC1Q01954 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BNC1Q01954 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BNC1Q01954 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BNC1Q01954 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BNC1Q01954 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
BNC1Q01954 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BNC1Q01954 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BNC1Q01954 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BNC1Q01954 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
BNC1Q01954 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BNC1Q01954 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BNC1Q01954 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BNC1Q01954 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BNC1Q01954 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BNC1Q01954 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BNC1Q01954 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BNC1Q01954 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BNC1Q01954 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BNC1Q01954 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
BNC1Q01954 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BNC1Q01954 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BNC1Q01954 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BNC1Q01954 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BNC1Q01954 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BNC1Q01954 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BNC1Q01954 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BNC1Q01954 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
BNC1Q01954 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BNC1Q01954 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BNC1Q01954 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BNC1Q01954 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BNC1Q01954 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BNC1Q01954 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BNC1Q01954 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BNC1Q01954 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BNC1Q01954 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BNC1Q01954 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BNC1Q01954 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BNC1Q01954 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BNC1Q01954 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BNC1Q01954 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BNC1Q01954 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BNC1Q01954 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BNC1Q01954 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BNC1Q01954 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BNC1Q01954 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BNC1Q01954 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BNC1Q01954 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BNC1Q01954 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BNC1Q01954 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BNC1Q01954 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BNC1Q01954 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BNC1Q01954 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BNC1Q01954 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BNC1Q01954 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BNC1Q01954 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BNC1Q01954 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BNC1Q01954 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BNC1Q01954 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BNC1Q01954 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BNC1Q01954 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BNC1Q01954 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BNC1Q01954 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BNC1Q01954 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BNC1Q01954 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BNC1Q01954 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BNC1Q01954 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BNC1Q01954 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BNC1Q01954 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BNC1Q01954 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BNC1Q01954 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
BNC1Q01954 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BNC1Q01954 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BNC1Q01954 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
BNC1Q01954 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BNC1Q01954 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BNC1Q01954 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BNC1Q01954 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
BNC1Q01954 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BNC1Q01954 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms