Protein–RNA interactions for Protein: Q00526

CDK3, Cyclin-dependent kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK3Q00526 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDK3Q00526 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDK3Q00526 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDK3Q00526 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CDK3Q00526 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDK3Q00526 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDK3Q00526 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDK3Q00526 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDK3Q00526 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDK3Q00526 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDK3Q00526 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDK3Q00526 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDK3Q00526 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDK3Q00526 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDK3Q00526 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDK3Q00526 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDK3Q00526 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDK3Q00526 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDK3Q00526 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDK3Q00526 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CDK3Q00526 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CDK3Q00526 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDK3Q00526 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CDK3Q00526 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDK3Q00526 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDK3Q00526 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDK3Q00526 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDK3Q00526 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDK3Q00526 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDK3Q00526 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDK3Q00526 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDK3Q00526 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDK3Q00526 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDK3Q00526 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDK3Q00526 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDK3Q00526 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDK3Q00526 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDK3Q00526 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDK3Q00526 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDK3Q00526 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDK3Q00526 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDK3Q00526 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDK3Q00526 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDK3Q00526 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CDK3Q00526 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDK3Q00526 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDK3Q00526 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDK3Q00526 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDK3Q00526 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDK3Q00526 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDK3Q00526 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDK3Q00526 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDK3Q00526 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDK3Q00526 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CDK3Q00526 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDK3Q00526 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDK3Q00526 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDK3Q00526 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDK3Q00526 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK3Q00526 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK3Q00526 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK3Q00526 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK3Q00526 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK3Q00526 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK3Q00526 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK3Q00526 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK3Q00526 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK3Q00526 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK3Q00526 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK3Q00526 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK3Q00526 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK3Q00526 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK3Q00526 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK3Q00526 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK3Q00526 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDK3Q00526 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDK3Q00526 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDK3Q00526 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CDK3Q00526 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CDK3Q00526 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDK3Q00526 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CDK3Q00526 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDK3Q00526 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK3Q00526 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK3Q00526 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK3Q00526 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK3Q00526 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK3Q00526 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK3Q00526 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDK3Q00526 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDK3Q00526 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDK3Q00526 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDK3Q00526 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDK3Q00526 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDK3Q00526 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDK3Q00526 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK3Q00526 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK3Q00526 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK3Q00526 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK3Q00526 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.7 ms