Protein–RNA interactions for Protein: P98161

PKD1, Polycystin-1, humanhuman

Predictions only

Length 4,303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD1P98161 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PKD1P98161 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PKD1P98161 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PKD1P98161 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PKD1P98161 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PKD1P98161 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PKD1P98161 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PKD1P98161 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PKD1P98161 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PKD1P98161 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PKD1P98161 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PKD1P98161 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PKD1P98161 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PKD1P98161 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PKD1P98161 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PKD1P98161 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PKD1P98161 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PKD1P98161 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PKD1P98161 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PKD1P98161 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PKD1P98161 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKD1P98161 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKD1P98161 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKD1P98161 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKD1P98161 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKD1P98161 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKD1P98161 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKD1P98161 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PKD1P98161 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PKD1P98161 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PKD1P98161 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PKD1P98161 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PKD1P98161 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PKD1P98161 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PKD1P98161 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PKD1P98161 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PKD1P98161 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PKD1P98161 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PKD1P98161 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PKD1P98161 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PKD1P98161 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PKD1P98161 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PKD1P98161 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PKD1P98161 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PKD1P98161 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PKD1P98161 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PKD1P98161 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PKD1P98161 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PKD1P98161 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PKD1P98161 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PKD1P98161 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PKD1P98161 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PKD1P98161 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PKD1P98161 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PKD1P98161 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PKD1P98161 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PKD1P98161 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PKD1P98161 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PKD1P98161 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PKD1P98161 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PKD1P98161 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PKD1P98161 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PKD1P98161 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PKD1P98161 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PKD1P98161 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PKD1P98161 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PKD1P98161 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PKD1P98161 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PKD1P98161 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PKD1P98161 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PKD1P98161 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PKD1P98161 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PKD1P98161 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PKD1P98161 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PKD1P98161 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PKD1P98161 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PKD1P98161 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
PKD1P98161 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PKD1P98161 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PKD1P98161 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PKD1P98161 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PKD1P98161 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PKD1P98161 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PKD1P98161 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PKD1P98161 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PKD1P98161 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PKD1P98161 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PKD1P98161 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PKD1P98161 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PKD1P98161 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PKD1P98161 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PKD1P98161 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PKD1P98161 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PKD1P98161 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PKD1P98161 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PKD1P98161 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PKD1P98161 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PKD1P98161 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PKD1P98161 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PKD1P98161 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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