Protein–RNA interactions for Protein: P85037

FOXK1, Forkhead box protein K1, humanhuman

Predictions only

Length 733 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXK1P85037 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXK1P85037 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXK1P85037 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXK1P85037 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXK1P85037 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXK1P85037 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXK1P85037 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXK1P85037 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXK1P85037 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXK1P85037 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXK1P85037 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXK1P85037 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXK1P85037 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXK1P85037 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXK1P85037 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXK1P85037 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXK1P85037 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXK1P85037 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXK1P85037 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FOXK1P85037 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FOXK1P85037 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXK1P85037 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXK1P85037 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXK1P85037 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXK1P85037 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXK1P85037 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXK1P85037 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXK1P85037 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXK1P85037 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXK1P85037 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXK1P85037 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXK1P85037 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXK1P85037 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXK1P85037 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXK1P85037 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXK1P85037 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXK1P85037 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXK1P85037 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXK1P85037 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXK1P85037 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXK1P85037 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXK1P85037 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXK1P85037 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXK1P85037 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXK1P85037 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXK1P85037 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXK1P85037 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXK1P85037 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXK1P85037 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXK1P85037 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXK1P85037 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXK1P85037 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXK1P85037 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXK1P85037 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXK1P85037 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXK1P85037 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXK1P85037 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXK1P85037 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXK1P85037 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXK1P85037 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXK1P85037 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOXK1P85037 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOXK1P85037 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOXK1P85037 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
FOXK1P85037 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
FOXK1P85037 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
FOXK1P85037 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXK1P85037 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXK1P85037 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXK1P85037 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXK1P85037 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXK1P85037 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXK1P85037 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXK1P85037 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXK1P85037 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXK1P85037 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXK1P85037 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXK1P85037 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXK1P85037 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXK1P85037 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXK1P85037 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FOXK1P85037 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FOXK1P85037 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FOXK1P85037 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
FOXK1P85037 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22■■□□□ 1.11
FOXK1P85037 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22■■□□□ 1.11
FOXK1P85037 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FOXK1P85037 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FOXK1P85037 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
FOXK1P85037 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FOXK1P85037 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FOXK1P85037 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXK1P85037 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXK1P85037 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXK1P85037 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXK1P85037 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXK1P85037 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXK1P85037 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXK1P85037 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXK1P85037 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms