Protein–RNA interactions for Protein: P63208

SKP1, S-phase kinase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP1P63208 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SKP1P63208 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SKP1P63208 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SKP1P63208 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SKP1P63208 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SKP1P63208 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SKP1P63208 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SKP1P63208 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SKP1P63208 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SKP1P63208 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SKP1P63208 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SKP1P63208 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SKP1P63208 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SKP1P63208 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SKP1P63208 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SKP1P63208 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SKP1P63208 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SKP1P63208 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SKP1P63208 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SKP1P63208 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SKP1P63208 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SKP1P63208 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SKP1P63208 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SKP1P63208 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SKP1P63208 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SKP1P63208 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SKP1P63208 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SKP1P63208 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SKP1P63208 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SKP1P63208 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SKP1P63208 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SKP1P63208 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SKP1P63208 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SKP1P63208 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SKP1P63208 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SKP1P63208 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SKP1P63208 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SKP1P63208 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SKP1P63208 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SKP1P63208 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SKP1P63208 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SKP1P63208 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SKP1P63208 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SKP1P63208 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SKP1P63208 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SKP1P63208 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SKP1P63208 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SKP1P63208 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SKP1P63208 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SKP1P63208 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SKP1P63208 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SKP1P63208 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SKP1P63208 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SKP1P63208 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SKP1P63208 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SKP1P63208 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SKP1P63208 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SKP1P63208 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SKP1P63208 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SKP1P63208 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SKP1P63208 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SKP1P63208 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SKP1P63208 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SKP1P63208 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SKP1P63208 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SKP1P63208 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SKP1P63208 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SKP1P63208 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SKP1P63208 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SKP1P63208 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SKP1P63208 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SKP1P63208 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SKP1P63208 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SKP1P63208 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SKP1P63208 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SKP1P63208 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SKP1P63208 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SKP1P63208 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SKP1P63208 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SKP1P63208 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SKP1P63208 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SKP1P63208 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SKP1P63208 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SKP1P63208 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SKP1P63208 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SKP1P63208 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SKP1P63208 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SKP1P63208 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SKP1P63208 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SKP1P63208 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SKP1P63208 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SKP1P63208 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SKP1P63208 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SKP1P63208 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SKP1P63208 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SKP1P63208 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SKP1P63208 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SKP1P63208 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SKP1P63208 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SKP1P63208 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms