Protein–RNA interactions for Protein: P60484

PTEN, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate 3-phosphatase and dual-specificity protein phosphatase PTEN, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTENP60484 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
PTENP60484 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTENP60484 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
PTENP60484 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTENP60484 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTENP60484 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTENP60484 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTENP60484 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTENP60484 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTENP60484 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTENP60484 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTENP60484 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTENP60484 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
PTENP60484 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTENP60484 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTENP60484 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTENP60484 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTENP60484 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PTENP60484 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTENP60484 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTENP60484 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTENP60484 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTENP60484 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTENP60484 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTENP60484 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTENP60484 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTENP60484 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTENP60484 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
PTENP60484 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
PTENP60484 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTENP60484 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
PTENP60484 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTENP60484 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
PTENP60484 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTENP60484 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTENP60484 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTENP60484 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTENP60484 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTENP60484 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTENP60484 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTENP60484 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTENP60484 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTENP60484 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PTENP60484 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTENP60484 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
PTENP60484 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTENP60484 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTENP60484 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTENP60484 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTENP60484 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTENP60484 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTENP60484 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTENP60484 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTENP60484 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTENP60484 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTENP60484 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTENP60484 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTENP60484 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTENP60484 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTENP60484 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTENP60484 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTENP60484 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTENP60484 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PTENP60484 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PTENP60484 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTENP60484 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTENP60484 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTENP60484 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTENP60484 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTENP60484 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTENP60484 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTENP60484 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTENP60484 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PTENP60484 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTENP60484 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTENP60484 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTENP60484 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTENP60484 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTENP60484 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PTENP60484 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTENP60484 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTENP60484 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTENP60484 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTENP60484 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTENP60484 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTENP60484 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTENP60484 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTENP60484 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTENP60484 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTENP60484 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTENP60484 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTENP60484 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTENP60484 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTENP60484 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTENP60484 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTENP60484 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTENP60484 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTENP60484 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PTENP60484 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTENP60484 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85 ms