Protein–RNA interactions for Protein: P57739

CLDN2, Claudin-2, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN2P57739 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLDN2P57739 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLDN2P57739 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLDN2P57739 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLDN2P57739 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CLDN2P57739 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLDN2P57739 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLDN2P57739 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLDN2P57739 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLDN2P57739 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLDN2P57739 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLDN2P57739 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CLDN2P57739 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CLDN2P57739 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLDN2P57739 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLDN2P57739 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CLDN2P57739 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLDN2P57739 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLDN2P57739 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLDN2P57739 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLDN2P57739 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CLDN2P57739 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLDN2P57739 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLDN2P57739 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLDN2P57739 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLDN2P57739 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLDN2P57739 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLDN2P57739 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLDN2P57739 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLDN2P57739 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLDN2P57739 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLDN2P57739 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLDN2P57739 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLDN2P57739 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLDN2P57739 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLDN2P57739 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLDN2P57739 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLDN2P57739 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLDN2P57739 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLDN2P57739 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLDN2P57739 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CLDN2P57739 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLDN2P57739 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLDN2P57739 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLDN2P57739 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLDN2P57739 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLDN2P57739 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLDN2P57739 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLDN2P57739 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLDN2P57739 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLDN2P57739 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLDN2P57739 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLDN2P57739 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLDN2P57739 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLDN2P57739 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLDN2P57739 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLDN2P57739 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLDN2P57739 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CLDN2P57739 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CLDN2P57739 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLDN2P57739 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLDN2P57739 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLDN2P57739 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLDN2P57739 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLDN2P57739 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CLDN2P57739 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLDN2P57739 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLDN2P57739 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLDN2P57739 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLDN2P57739 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLDN2P57739 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLDN2P57739 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CLDN2P57739 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLDN2P57739 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLDN2P57739 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLDN2P57739 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLDN2P57739 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLDN2P57739 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLDN2P57739 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLDN2P57739 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLDN2P57739 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLDN2P57739 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLDN2P57739 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLDN2P57739 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLDN2P57739 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLDN2P57739 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLDN2P57739 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLDN2P57739 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLDN2P57739 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CLDN2P57739 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CLDN2P57739 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLDN2P57739 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLDN2P57739 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLDN2P57739 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLDN2P57739 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CLDN2P57739 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CLDN2P57739 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLDN2P57739 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLDN2P57739 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLDN2P57739 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms