Protein–RNA interactions for Protein: P55809

OXCT1, Succinyl-CoA:3-ketoacid coenzyme A transferase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OXCT1P55809 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
OXCT1P55809 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
OXCT1P55809 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
OXCT1P55809 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
OXCT1P55809 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
OXCT1P55809 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
OXCT1P55809 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
OXCT1P55809 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
OXCT1P55809 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
OXCT1P55809 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
OXCT1P55809 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
OXCT1P55809 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
OXCT1P55809 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
OXCT1P55809 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
OXCT1P55809 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
OXCT1P55809 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
OXCT1P55809 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
OXCT1P55809 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
OXCT1P55809 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
OXCT1P55809 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
OXCT1P55809 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
OXCT1P55809 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
OXCT1P55809 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
OXCT1P55809 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
OXCT1P55809 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
OXCT1P55809 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
OXCT1P55809 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
OXCT1P55809 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
OXCT1P55809 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
OXCT1P55809 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
OXCT1P55809 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
OXCT1P55809 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
OXCT1P55809 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
OXCT1P55809 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
OXCT1P55809 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
OXCT1P55809 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
OXCT1P55809 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
OXCT1P55809 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
OXCT1P55809 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
OXCT1P55809 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
OXCT1P55809 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
OXCT1P55809 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
OXCT1P55809 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
OXCT1P55809 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
OXCT1P55809 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
OXCT1P55809 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
OXCT1P55809 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
OXCT1P55809 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
OXCT1P55809 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
OXCT1P55809 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
OXCT1P55809 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
OXCT1P55809 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
OXCT1P55809 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
OXCT1P55809 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
OXCT1P55809 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
OXCT1P55809 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
OXCT1P55809 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
OXCT1P55809 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
OXCT1P55809 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
OXCT1P55809 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
OXCT1P55809 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
OXCT1P55809 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
OXCT1P55809 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
OXCT1P55809 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
OXCT1P55809 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
OXCT1P55809 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
OXCT1P55809 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
OXCT1P55809 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
OXCT1P55809 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
OXCT1P55809 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
OXCT1P55809 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
OXCT1P55809 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
OXCT1P55809 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
OXCT1P55809 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
OXCT1P55809 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
OXCT1P55809 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
OXCT1P55809 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
OXCT1P55809 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
OXCT1P55809 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
OXCT1P55809 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
OXCT1P55809 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
OXCT1P55809 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
OXCT1P55809 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
OXCT1P55809 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
OXCT1P55809 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
OXCT1P55809 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
OXCT1P55809 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
OXCT1P55809 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
OXCT1P55809 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
OXCT1P55809 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
OXCT1P55809 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
OXCT1P55809 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
OXCT1P55809 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
OXCT1P55809 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
OXCT1P55809 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
OXCT1P55809 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
OXCT1P55809 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
OXCT1P55809 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
OXCT1P55809 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
OXCT1P55809 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms