Protein–RNA interactions for Protein: P55289

CDH12, Cadherin-12, humanhuman

Predictions only

Length 794 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH12P55289 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDH12P55289 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CDH12P55289 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CDH12P55289 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH12P55289 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH12P55289 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH12P55289 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH12P55289 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH12P55289 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH12P55289 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH12P55289 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH12P55289 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CDH12P55289 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDH12P55289 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDH12P55289 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CDH12P55289 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDH12P55289 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDH12P55289 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDH12P55289 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CDH12P55289 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDH12P55289 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CDH12P55289 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH12P55289 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH12P55289 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH12P55289 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH12P55289 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH12P55289 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH12P55289 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH12P55289 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH12P55289 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH12P55289 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH12P55289 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH12P55289 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH12P55289 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH12P55289 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH12P55289 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH12P55289 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH12P55289 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDH12P55289 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDH12P55289 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDH12P55289 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CDH12P55289 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDH12P55289 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDH12P55289 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDH12P55289 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDH12P55289 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDH12P55289 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDH12P55289 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDH12P55289 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDH12P55289 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDH12P55289 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDH12P55289 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDH12P55289 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDH12P55289 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDH12P55289 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDH12P55289 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDH12P55289 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDH12P55289 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDH12P55289 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDH12P55289 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CDH12P55289 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDH12P55289 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDH12P55289 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDH12P55289 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDH12P55289 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDH12P55289 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CDH12P55289 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDH12P55289 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDH12P55289 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDH12P55289 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDH12P55289 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDH12P55289 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDH12P55289 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDH12P55289 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDH12P55289 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDH12P55289 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDH12P55289 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDH12P55289 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDH12P55289 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDH12P55289 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDH12P55289 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDH12P55289 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDH12P55289 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDH12P55289 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDH12P55289 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDH12P55289 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDH12P55289 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDH12P55289 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDH12P55289 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDH12P55289 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDH12P55289 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CDH12P55289 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDH12P55289 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDH12P55289 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDH12P55289 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CDH12P55289 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDH12P55289 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDH12P55289 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDH12P55289 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDH12P55289 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms