Protein–RNA interactions for Protein: P54727

RAD23B, UV excision repair protein RAD23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23BP54727 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAD23BP54727 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAD23BP54727 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAD23BP54727 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAD23BP54727 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAD23BP54727 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAD23BP54727 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAD23BP54727 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAD23BP54727 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAD23BP54727 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAD23BP54727 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAD23BP54727 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAD23BP54727 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAD23BP54727 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAD23BP54727 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAD23BP54727 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAD23BP54727 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAD23BP54727 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAD23BP54727 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAD23BP54727 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAD23BP54727 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAD23BP54727 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAD23BP54727 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAD23BP54727 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAD23BP54727 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAD23BP54727 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAD23BP54727 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RAD23BP54727 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RAD23BP54727 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RAD23BP54727 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RAD23BP54727 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RAD23BP54727 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RAD23BP54727 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
RAD23BP54727 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAD23BP54727 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAD23BP54727 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAD23BP54727 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAD23BP54727 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAD23BP54727 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAD23BP54727 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAD23BP54727 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAD23BP54727 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAD23BP54727 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAD23BP54727 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
RAD23BP54727 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAD23BP54727 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAD23BP54727 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAD23BP54727 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAD23BP54727 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAD23BP54727 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAD23BP54727 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAD23BP54727 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAD23BP54727 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAD23BP54727 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAD23BP54727 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAD23BP54727 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAD23BP54727 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAD23BP54727 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAD23BP54727 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAD23BP54727 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAD23BP54727 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAD23BP54727 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAD23BP54727 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAD23BP54727 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAD23BP54727 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAD23BP54727 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAD23BP54727 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAD23BP54727 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
RAD23BP54727 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
RAD23BP54727 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
RAD23BP54727 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAD23BP54727 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAD23BP54727 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAD23BP54727 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAD23BP54727 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAD23BP54727 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAD23BP54727 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAD23BP54727 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAD23BP54727 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAD23BP54727 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAD23BP54727 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAD23BP54727 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAD23BP54727 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAD23BP54727 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAD23BP54727 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAD23BP54727 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAD23BP54727 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAD23BP54727 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAD23BP54727 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAD23BP54727 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RAD23BP54727 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAD23BP54727 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAD23BP54727 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAD23BP54727 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAD23BP54727 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RAD23BP54727 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RAD23BP54727 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAD23BP54727 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAD23BP54727 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAD23BP54727 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms