Protein–RNA interactions for Protein: P52797

EFNA3, Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA3P52797 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EFNA3P52797 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EFNA3P52797 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EFNA3P52797 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EFNA3P52797 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EFNA3P52797 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EFNA3P52797 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EFNA3P52797 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EFNA3P52797 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EFNA3P52797 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
EFNA3P52797 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
EFNA3P52797 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EFNA3P52797 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EFNA3P52797 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EFNA3P52797 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EFNA3P52797 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EFNA3P52797 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EFNA3P52797 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EFNA3P52797 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EFNA3P52797 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EFNA3P52797 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EFNA3P52797 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EFNA3P52797 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EFNA3P52797 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EFNA3P52797 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
EFNA3P52797 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EFNA3P52797 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EFNA3P52797 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EFNA3P52797 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EFNA3P52797 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EFNA3P52797 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
EFNA3P52797 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EFNA3P52797 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EFNA3P52797 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EFNA3P52797 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EFNA3P52797 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EFNA3P52797 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
EFNA3P52797 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EFNA3P52797 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EFNA3P52797 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EFNA3P52797 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EFNA3P52797 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EFNA3P52797 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EFNA3P52797 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
EFNA3P52797 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EFNA3P52797 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EFNA3P52797 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EFNA3P52797 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EFNA3P52797 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EFNA3P52797 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EFNA3P52797 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EFNA3P52797 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EFNA3P52797 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EFNA3P52797 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EFNA3P52797 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EFNA3P52797 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EFNA3P52797 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EFNA3P52797 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EFNA3P52797 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EFNA3P52797 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EFNA3P52797 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
EFNA3P52797 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EFNA3P52797 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EFNA3P52797 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EFNA3P52797 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EFNA3P52797 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EFNA3P52797 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EFNA3P52797 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EFNA3P52797 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EFNA3P52797 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
EFNA3P52797 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EFNA3P52797 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EFNA3P52797 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EFNA3P52797 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EFNA3P52797 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EFNA3P52797 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EFNA3P52797 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EFNA3P52797 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EFNA3P52797 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EFNA3P52797 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EFNA3P52797 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EFNA3P52797 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EFNA3P52797 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EFNA3P52797 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EFNA3P52797 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EFNA3P52797 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
EFNA3P52797 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EFNA3P52797 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EFNA3P52797 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EFNA3P52797 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EFNA3P52797 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EFNA3P52797 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EFNA3P52797 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EFNA3P52797 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EFNA3P52797 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EFNA3P52797 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EFNA3P52797 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EFNA3P52797 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EFNA3P52797 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EFNA3P52797 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms