Protein–RNA interactions for Protein: P52272

HNRNPM, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein M, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNRNPMP52272 RPS15A-206ENST00000569083 1022 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.395e-8■■■■■ 33.8
HNRNPMP52272 RPS15A-201ENST00000322989 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.185e-8■■■■■ 33.8
HNRNPMP52272 RPS15A-208ENST00000572008 797 ntTSL 511.47□□□□□ -0.575e-8■■■■■ 33.8
HNRNPMP52272 RPS15A-212ENST00000576008 589 ntTSL 1 (best)7.77□□□□□ -1.175e-8■■■■■ 33.8
HNRNPMP52272 RPS15A-202ENST00000562935 427 ntTSL 27.72□□□□□ -1.175e-8■■■■■ 33.8
HNRNPMP52272 RPS15A-203ENST00000563390 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.175e-8■■■■■ 33.8
HNRNPMP52272 RPS15A-207ENST00000569365 481 ntTSL 37.56□□□□□ -1.25e-8■■■■■ 33.8
HNRNPMP52272 RPS15A-210ENST00000574723 418 ntTSL 33.68□□□□□ -1.825e-8■■■■■ 33.8
HNRNPMP52272 CELF1-203ENST00000361904 1580 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.232e-8■■■■■ 33.8
HNRNPMP52272 CELF1-204ENST00000395290 7666 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.232e-8■■■■■ 33.8
HNRNPMP52272 CELF1-202ENST00000358597 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.352e-8■■■■■ 33.8
HNRNPMP52272 CELF1-205ENST00000395292 2191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.352e-8■■■■■ 33.8
HNRNPMP52272 MGAT4A-205ENST00000460768 426 ntTSL 228.38■■■□□ 2.131e-6■■■■■ 33.8
HNRNPMP52272 CAD-207ENST00000475695 687 ntTSL 326.7■■□□□ 1.862e-7■■■■■ 33.7
HNRNPMP52272 COMT-207ENST00000412786 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 225.37■■□□□ 1.657e-10■■■■■ 33.7
HNRNPMP52272 COMT-201ENST00000207636 1319 ntTSL 524.04■■□□□ 1.447e-10■■■■■ 33.7
HNRNPMP52272 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.447e-10■■■■■ 33.7
HNRNPMP52272 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.076e-7■■■■■ 33.7
HNRNPMP52272 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.496e-7■■■■■ 33.7
HNRNPMP52272 CAD-202ENST00000403525 6900 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.352e-7■■■■■ 33.7
HNRNPMP52272 CAD-201ENST00000264705 7265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.072e-7■■■■■ 33.7
HNRNPMP52272 UBR3-204ENST00000430321 5411 ntTSL 57.47□□□□□ -1.216e-7■■■■■ 33.7
HNRNPMP52272 UBR3-202ENST00000392632 5129 ntTSL 54.78□□□□□ -1.646e-7■■■■■ 33.7
HNRNPMP52272 PHKB-217ENST00000570047 797 ntTSL 315.93■□□□□ 0.142e-7■■■■■ 33.7
HNRNPMP52272 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.347e-7■■■■■ 33.6
HNRNPMP52272 RERE-201ENST00000337907 8026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.017e-7■■■■■ 33.6
HNRNPMP52272 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.213e-6■■■■■ 33.6
HNRNPMP52272 KIF2A-201ENST00000381103 3360 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.053e-6■■■■■ 33.6
HNRNPMP52272 KIF2A-204ENST00000504883 783 ntTSL 213.7□□□□□ -0.223e-6■■■■■ 33.6
HNRNPMP52272 KIF2A-210ENST00000514082 874 ntTSL 1 (best)10.72□□□□□ -0.693e-6■■■■■ 33.6
HNRNPMP52272 KIF2A-203ENST00000407818 2315 ntTSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.13e-6■■■■■ 33.6
HNRNPMP52272 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.593e-7■■■■■ 33.6
HNRNPMP52272 DGCR8-202ENST00000383024 4419 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.33e-7■■■■■ 33.6
HNRNPMP52272 TRAPPC9-210ENST00000521667 2021 ntTSL 1 (best)26.64■■□□□ 1.869e-7■■■■■ 33.6
HNRNPMP52272 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.117e-7■■■■■ 33.6
HNRNPMP52272 USP7-208ENST00000563961 4533 ntTSL 518.99■□□□□ 0.637e-7■■■■■ 33.6
HNRNPMP52272 USP7-215ENST00000566273 577 ntTSL 418.54■□□□□ 0.567e-7■■■■■ 33.6
HNRNPMP52272 USP7-219ENST00000569230 569 ntTSL 58.22□□□□□ -1.096e-7■■■■■ 33.6
HNRNPMP52272 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.15e-7■■■■■ 33.6
HNRNPMP52272 RPS10-NUDT3-203ENST00000639877 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.025e-7■■■■■ 33.6
HNRNPMP52272 RPS10-NUDT3-202ENST00000639725 4782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.365e-7■■■■■ 33.6
HNRNPMP52272 RPS10-NUDT3-201ENST00000605528 595 ntTSL 510.59□□□□□ -0.715e-7■■■■■ 33.6
HNRNPMP52272 PVT1-214ENST00000522875 922 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.85e-7■■■■■ 33.6
HNRNPMP52272 PVT1-217ENST00000523190 443 ntTSL 310.02□□□□□ -0.815e-7■■■■■ 33.6
HNRNPMP52272 PVT1-211ENST00000521600 408 ntTSL 26□□□□□ -1.455e-7■■■■■ 33.6
HNRNPMP52272 PVT1-202ENST00000512617 383 ntTSL 33.46□□□□□ -1.865e-7■■■■■ 33.6
HNRNPMP52272 RNF114-208ENST00000625177 580 ntTSL 337.95■■■■□ 3.678e-15■■■■■ 33.6
HNRNPMP52272 RNF114-205ENST00000623732 569 ntTSL 537.93■■■■□ 3.668e-15■■■■■ 33.6
HNRNPMP52272 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.998e-15■■■■■ 33.6
HNRNPMP52272 RNF114-204ENST00000623528 624 ntTSL 331.16■■■□□ 2.588e-15■■■■■ 33.6
HNRNPMP52272 RNF114-206ENST00000624620 565 ntTSL 230.68■■■□□ 2.58e-15■■■■■ 33.6
HNRNPMP52272 RNF114-203ENST00000622999 2438 ntTSL 227.78■■■□□ 2.048e-15■■■■■ 33.6
HNRNPMP52272 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.678e-15■■■■■ 33.6
HNRNPMP52272 ALDH1A2-208ENST00000558239 664 ntTSL 418.53■□□□□ 0.563e-7■■■■■ 33.6
HNRNPMP52272 ALDH1A2-205ENST00000557967 577 ntTSL 415.51■□□□□ 0.073e-7■■■■■ 33.6
HNRNPMP52272 ALDH1A2-212ENST00000558595 484 ntTSL 315.42■□□□□ 0.063e-7■■■■■ 33.6
HNRNPMP52272 ALDH1A2-206ENST00000558073 581 ntTSL 413.74□□□□□ -0.213e-7■■■■■ 33.6
HNRNPMP52272 ALDH1A2-220ENST00000560122 562 ntTSL 513.6□□□□□ -0.233e-7■■■■■ 33.6
HNRNPMP52272 ALDH1A2-216ENST00000559297 542 ntTSL 410.3□□□□□ -0.763e-7■■■■■ 33.6
HNRNPMP52272 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.573e-7■■■■■ 33.6
HNRNPMP52272 HNRNPM-214ENST00000600806 2373 ntTSL 526.74■■□□□ 1.873e-7■■■■■ 33.6
HNRNPMP52272 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.863e-7■■■■■ 33.6
HNRNPMP52272 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.613e-7■■■■■ 33.6
HNRNPMP52272 CMC1-201ENST00000334841 724 ntTSL 323.13■■□□□ 1.291e-6■■■■■ 33.5
HNRNPMP52272 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.281e-6■■■■■ 33.5
HNRNPMP52272 CMC1-205ENST00000466830 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.071e-6■■■■■ 33.5
HNRNPMP52272 CMC1-209ENST00000477739 3749 ntTSL 1 (best)13.15□□□□□ -0.31e-6■■■■■ 33.5
HNRNPMP52272 CMC1-202ENST00000396610 593 ntTSL 25.14□□□□□ -1.591e-6■■■■■ 33.5
HNRNPMP52272 CMC1-203ENST00000418849 484 ntTSL 34.14□□□□□ -1.751e-6■■■■■ 33.5
HNRNPMP52272 MBTPS1-201ENST00000343411 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.311e-6■■■■■ 33.5
HNRNPMP52272 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.31e-7■■■■■ 33.5
HNRNPMP52272 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.461e-7■■■■■ 33.5
HNRNPMP52272 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.371e-7■■■■■ 33.5
HNRNPMP52272 RSBN1-206ENST00000616024 2703 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.241e-7■■■■■ 33.5
HNRNPMP52272 RSBN1-203ENST00000476412 3772 ntTSL 213.4□□□□□ -0.261e-7■■■■■ 33.5
HNRNPMP52272 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.43e-8■■■■■ 33.5
HNRNPMP52272 RPL13A-214ENST00000624069 1122 ntTSL 1 (best)23.77■■□□□ 1.43e-8■■■■■ 33.5
HNRNPMP52272 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.093e-8■■■■■ 33.5
HNRNPMP52272 RPL13A-212ENST00000488946 2312 ntTSL 220.1■□□□□ 0.813e-8■■■■■ 33.5
HNRNPMP52272 HNRNPM-204ENST00000594907 1078 ntTSL 530.57■■■□□ 2.483e-7■■■■■ 33.5
HNRNPMP52272 AP2A2-206ENST00000525891 743 ntTSL 431.94■■■□□ 2.75e-7■■■■■ 33.4
HNRNPMP52272 HDLBP-237ENST00000479169 1017 ntTSL 217.99■□□□□ 0.474e-8■■■■■ 33.4
HNRNPMP52272 HDLBP-228ENST00000459788 563 ntTSL 215.87■□□□□ 0.134e-8■■■■■ 33.4
HNRNPMP52272 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.335e-7■■■■■ 33.4
HNRNPMP52272 SLC39A14-209ENST00000520644 377 ntTSL 531.71■■■□□ 2.678e-8■■■■■ 33.4
HNRNPMP52272 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.668e-8■■■■■ 33.4
HNRNPMP52272 SLC39A14-212ENST00000524285 570 ntTSL 428.28■■■□□ 2.128e-8■■■■■ 33.4
HNRNPMP52272 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.328e-8■■■■■ 33.4
HNRNPMP52272 SLC39A14-204ENST00000381237 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.168e-8■■■■■ 33.4
HNRNPMP52272 SLC39A14-203ENST00000359741 4641 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.158e-8■■■■■ 33.4
HNRNPMP52272 ASPSCR1-203ENST00000344865 1041 ntTSL 236.25■■■■□ 3.391e-8■■■■■ 33.3
HNRNPMP52272 HGS-215ENST00000576393 922 ntTSL 233.24■■■□□ 2.911e-8■■■■■ 33.3
HNRNPMP52272 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.45■■■□□ 2.791e-8■■■■■ 33.3
HNRNPMP52272 HGS-205ENST00000571518 644 ntTSL 232.32■■■□□ 2.761e-8■■■■■ 33.3
HNRNPMP52272 HGS-217ENST00000577012 716 ntTSL 531.86■■■□□ 2.691e-8■■■■■ 33.3
HNRNPMP52272 QPRT-201ENST00000219771 913 ntTSL 228.91■■■□□ 2.221e-8■■■■■ 33.3
HNRNPMP52272 HGS-216ENST00000576498 1004 ntTSL 228.27■■■□□ 2.121e-8■■■■■ 33.3
HNRNPMP52272 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.981e-8■■■■■ 33.3
HNRNPMP52272 ASPSCR1-209ENST00000581484 1001 ntTSL 227.27■■□□□ 1.961e-8■■■■■ 33.3
HNRNPMP52272 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.91e-8■■■■■ 33.3
Retrieved 100 of 21,363 protein–RNA pairs in 426.4 ms