Protein–RNA interactions for Protein: P51449

RORC, Nuclear receptor ROR-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RORCP51449 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RORCP51449 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RORCP51449 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RORCP51449 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RORCP51449 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RORCP51449 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RORCP51449 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RORCP51449 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RORCP51449 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RORCP51449 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RORCP51449 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RORCP51449 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RORCP51449 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RORCP51449 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RORCP51449 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RORCP51449 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RORCP51449 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RORCP51449 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RORCP51449 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RORCP51449 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RORCP51449 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RORCP51449 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RORCP51449 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RORCP51449 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RORCP51449 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RORCP51449 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RORCP51449 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RORCP51449 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RORCP51449 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RORCP51449 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RORCP51449 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
RORCP51449 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RORCP51449 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RORCP51449 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RORCP51449 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
RORCP51449 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RORCP51449 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
RORCP51449 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
RORCP51449 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RORCP51449 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RORCP51449 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RORCP51449 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RORCP51449 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RORCP51449 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RORCP51449 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RORCP51449 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RORCP51449 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RORCP51449 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RORCP51449 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RORCP51449 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RORCP51449 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RORCP51449 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RORCP51449 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RORCP51449 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RORCP51449 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
RORCP51449 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RORCP51449 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
RORCP51449 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RORCP51449 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RORCP51449 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RORCP51449 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
RORCP51449 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RORCP51449 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RORCP51449 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RORCP51449 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RORCP51449 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RORCP51449 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RORCP51449 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RORCP51449 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RORCP51449 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RORCP51449 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RORCP51449 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RORCP51449 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RORCP51449 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RORCP51449 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RORCP51449 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RORCP51449 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RORCP51449 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RORCP51449 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RORCP51449 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RORCP51449 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RORCP51449 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RORCP51449 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RORCP51449 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RORCP51449 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RORCP51449 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
RORCP51449 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
RORCP51449 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RORCP51449 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RORCP51449 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RORCP51449 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RORCP51449 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RORCP51449 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RORCP51449 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RORCP51449 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RORCP51449 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RORCP51449 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RORCP51449 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RORCP51449 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RORCP51449 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms