Protein–RNA interactions for Protein: P51157

RAB28, Ras-related protein Rab-28, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB28P51157 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB28P51157 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB28P51157 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB28P51157 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB28P51157 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB28P51157 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB28P51157 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB28P51157 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB28P51157 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB28P51157 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB28P51157 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB28P51157 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB28P51157 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB28P51157 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB28P51157 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB28P51157 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB28P51157 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB28P51157 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB28P51157 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB28P51157 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB28P51157 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB28P51157 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RAB28P51157 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAB28P51157 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAB28P51157 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RAB28P51157 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAB28P51157 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RAB28P51157 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB28P51157 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB28P51157 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB28P51157 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB28P51157 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB28P51157 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB28P51157 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB28P51157 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB28P51157 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB28P51157 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB28P51157 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB28P51157 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB28P51157 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB28P51157 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB28P51157 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB28P51157 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB28P51157 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB28P51157 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB28P51157 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB28P51157 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB28P51157 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB28P51157 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB28P51157 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB28P51157 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB28P51157 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB28P51157 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB28P51157 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB28P51157 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB28P51157 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB28P51157 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB28P51157 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB28P51157 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB28P51157 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB28P51157 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB28P51157 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB28P51157 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB28P51157 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB28P51157 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB28P51157 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB28P51157 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB28P51157 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB28P51157 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB28P51157 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB28P51157 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB28P51157 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB28P51157 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB28P51157 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB28P51157 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB28P51157 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB28P51157 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB28P51157 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB28P51157 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB28P51157 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB28P51157 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB28P51157 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB28P51157 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB28P51157 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB28P51157 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB28P51157 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB28P51157 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB28P51157 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RAB28P51157 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RAB28P51157 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RAB28P51157 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB28P51157 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB28P51157 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB28P51157 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB28P51157 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB28P51157 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB28P51157 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB28P51157 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB28P51157 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB28P51157 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.3 ms