Protein–RNA interactions for Protein: P50591

TNFSF10, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 10, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF10P50591 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TNFSF10P50591 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TNFSF10P50591 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TNFSF10P50591 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TNFSF10P50591 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TNFSF10P50591 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TNFSF10P50591 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TNFSF10P50591 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TNFSF10P50591 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TNFSF10P50591 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TNFSF10P50591 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TNFSF10P50591 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TNFSF10P50591 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TNFSF10P50591 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TNFSF10P50591 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TNFSF10P50591 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TNFSF10P50591 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TNFSF10P50591 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TNFSF10P50591 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TNFSF10P50591 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TNFSF10P50591 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TNFSF10P50591 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TNFSF10P50591 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TNFSF10P50591 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TNFSF10P50591 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TNFSF10P50591 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TNFSF10P50591 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TNFSF10P50591 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TNFSF10P50591 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TNFSF10P50591 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TNFSF10P50591 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TNFSF10P50591 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TNFSF10P50591 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TNFSF10P50591 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TNFSF10P50591 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TNFSF10P50591 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TNFSF10P50591 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TNFSF10P50591 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TNFSF10P50591 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TNFSF10P50591 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TNFSF10P50591 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TNFSF10P50591 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TNFSF10P50591 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TNFSF10P50591 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TNFSF10P50591 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TNFSF10P50591 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TNFSF10P50591 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TNFSF10P50591 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TNFSF10P50591 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TNFSF10P50591 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TNFSF10P50591 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TNFSF10P50591 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TNFSF10P50591 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TNFSF10P50591 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TNFSF10P50591 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TNFSF10P50591 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TNFSF10P50591 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TNFSF10P50591 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TNFSF10P50591 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TNFSF10P50591 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TNFSF10P50591 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TNFSF10P50591 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TNFSF10P50591 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TNFSF10P50591 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TNFSF10P50591 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TNFSF10P50591 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TNFSF10P50591 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TNFSF10P50591 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TNFSF10P50591 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TNFSF10P50591 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TNFSF10P50591 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TNFSF10P50591 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TNFSF10P50591 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TNFSF10P50591 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TNFSF10P50591 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TNFSF10P50591 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TNFSF10P50591 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNFSF10P50591 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNFSF10P50591 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNFSF10P50591 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNFSF10P50591 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNFSF10P50591 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNFSF10P50591 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNFSF10P50591 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNFSF10P50591 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNFSF10P50591 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNFSF10P50591 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNFSF10P50591 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNFSF10P50591 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNFSF10P50591 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNFSF10P50591 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNFSF10P50591 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNFSF10P50591 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNFSF10P50591 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNFSF10P50591 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNFSF10P50591 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNFSF10P50591 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNFSF10P50591 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNFSF10P50591 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNFSF10P50591 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms