Protein–RNA interactions for Protein: P48449

LSS, Lanosterol synthase, humanhuman

Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSSP48449 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
LSSP48449 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
LSSP48449 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LSSP48449 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LSSP48449 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
LSSP48449 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LSSP48449 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LSSP48449 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LSSP48449 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LSSP48449 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LSSP48449 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LSSP48449 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LSSP48449 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LSSP48449 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LSSP48449 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LSSP48449 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LSSP48449 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LSSP48449 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LSSP48449 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LSSP48449 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LSSP48449 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LSSP48449 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LSSP48449 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LSSP48449 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LSSP48449 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LSSP48449 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LSSP48449 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LSSP48449 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LSSP48449 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LSSP48449 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LSSP48449 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LSSP48449 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LSSP48449 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LSSP48449 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LSSP48449 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LSSP48449 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LSSP48449 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LSSP48449 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LSSP48449 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LSSP48449 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LSSP48449 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LSSP48449 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LSSP48449 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LSSP48449 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LSSP48449 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LSSP48449 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LSSP48449 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LSSP48449 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
LSSP48449 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
LSSP48449 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LSSP48449 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LSSP48449 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LSSP48449 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LSSP48449 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
LSSP48449 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LSSP48449 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LSSP48449 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LSSP48449 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
LSSP48449 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LSSP48449 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LSSP48449 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LSSP48449 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LSSP48449 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LSSP48449 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LSSP48449 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LSSP48449 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LSSP48449 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LSSP48449 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LSSP48449 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LSSP48449 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LSSP48449 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LSSP48449 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LSSP48449 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LSSP48449 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LSSP48449 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LSSP48449 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LSSP48449 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LSSP48449 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LSSP48449 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LSSP48449 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LSSP48449 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LSSP48449 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LSSP48449 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LSSP48449 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LSSP48449 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LSSP48449 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LSSP48449 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LSSP48449 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LSSP48449 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LSSP48449 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LSSP48449 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LSSP48449 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LSSP48449 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LSSP48449 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LSSP48449 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
LSSP48449 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LSSP48449 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LSSP48449 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LSSP48449 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LSSP48449 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms