Protein–RNA interactions for Protein: P34741

SDC2, Syndecan-2, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDC2P34741 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SDC2P34741 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SDC2P34741 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
SDC2P34741 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SDC2P34741 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
SDC2P34741 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SDC2P34741 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SDC2P34741 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SDC2P34741 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SDC2P34741 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SDC2P34741 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SDC2P34741 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SDC2P34741 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SDC2P34741 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SDC2P34741 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SDC2P34741 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SDC2P34741 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SDC2P34741 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SDC2P34741 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SDC2P34741 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SDC2P34741 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SDC2P34741 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SDC2P34741 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SDC2P34741 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SDC2P34741 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SDC2P34741 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SDC2P34741 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SDC2P34741 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SDC2P34741 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SDC2P34741 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SDC2P34741 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SDC2P34741 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SDC2P34741 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SDC2P34741 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SDC2P34741 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SDC2P34741 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SDC2P34741 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SDC2P34741 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SDC2P34741 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SDC2P34741 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SDC2P34741 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SDC2P34741 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SDC2P34741 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SDC2P34741 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SDC2P34741 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SDC2P34741 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SDC2P34741 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SDC2P34741 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SDC2P34741 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SDC2P34741 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SDC2P34741 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SDC2P34741 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SDC2P34741 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SDC2P34741 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SDC2P34741 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SDC2P34741 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SDC2P34741 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SDC2P34741 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SDC2P34741 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SDC2P34741 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SDC2P34741 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SDC2P34741 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SDC2P34741 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SDC2P34741 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SDC2P34741 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SDC2P34741 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SDC2P34741 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SDC2P34741 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SDC2P34741 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
SDC2P34741 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SDC2P34741 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SDC2P34741 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SDC2P34741 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SDC2P34741 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SDC2P34741 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SDC2P34741 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SDC2P34741 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SDC2P34741 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SDC2P34741 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SDC2P34741 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SDC2P34741 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SDC2P34741 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SDC2P34741 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SDC2P34741 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
SDC2P34741 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SDC2P34741 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SDC2P34741 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SDC2P34741 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SDC2P34741 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SDC2P34741 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SDC2P34741 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SDC2P34741 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SDC2P34741 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SDC2P34741 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SDC2P34741 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SDC2P34741 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SDC2P34741 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SDC2P34741 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SDC2P34741 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SDC2P34741 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms