Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CNGA1P29973 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CNGA1P29973 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CNGA1P29973 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CNGA1P29973 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CNGA1P29973 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CNGA1P29973 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CNGA1P29973 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CNGA1P29973 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CNGA1P29973 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CNGA1P29973 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CNGA1P29973 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CNGA1P29973 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CNGA1P29973 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CNGA1P29973 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CNGA1P29973 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CNGA1P29973 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CNGA1P29973 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CNGA1P29973 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CNGA1P29973 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CNGA1P29973 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CNGA1P29973 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CNGA1P29973 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CNGA1P29973 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
CNGA1P29973 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CNGA1P29973 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CNGA1P29973 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CNGA1P29973 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CNGA1P29973 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CNGA1P29973 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CNGA1P29973 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CNGA1P29973 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CNGA1P29973 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CNGA1P29973 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CNGA1P29973 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CNGA1P29973 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CNGA1P29973 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CNGA1P29973 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CNGA1P29973 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CNGA1P29973 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CNGA1P29973 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CNGA1P29973 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CNGA1P29973 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CNGA1P29973 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CNGA1P29973 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CNGA1P29973 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CNGA1P29973 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CNGA1P29973 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CNGA1P29973 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CNGA1P29973 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CNGA1P29973 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CNGA1P29973 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CNGA1P29973 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CNGA1P29973 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CNGA1P29973 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CNGA1P29973 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CNGA1P29973 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CNGA1P29973 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CNGA1P29973 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CNGA1P29973 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CNGA1P29973 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CNGA1P29973 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CNGA1P29973 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CNGA1P29973 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CNGA1P29973 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CNGA1P29973 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CNGA1P29973 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CNGA1P29973 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CNGA1P29973 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CNGA1P29973 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CNGA1P29973 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CNGA1P29973 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CNGA1P29973 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CNGA1P29973 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CNGA1P29973 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CNGA1P29973 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CNGA1P29973 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CNGA1P29973 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CNGA1P29973 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CNGA1P29973 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CNGA1P29973 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CNGA1P29973 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CNGA1P29973 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CNGA1P29973 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CNGA1P29973 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CNGA1P29973 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CNGA1P29973 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CNGA1P29973 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CNGA1P29973 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CNGA1P29973 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CNGA1P29973 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CNGA1P29973 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CNGA1P29973 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CNGA1P29973 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CNGA1P29973 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CNGA1P29973 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CNGA1P29973 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CNGA1P29973 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CNGA1P29973 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CNGA1P29973 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms