Protein–RNA interactions for Protein: P28715

ERCC5, DNA repair protein complementing XP-G cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC5P28715 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ERCC5P28715 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ERCC5P28715 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ERCC5P28715 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ERCC5P28715 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ERCC5P28715 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ERCC5P28715 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ERCC5P28715 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ERCC5P28715 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ERCC5P28715 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
ERCC5P28715 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ERCC5P28715 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ERCC5P28715 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ERCC5P28715 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ERCC5P28715 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ERCC5P28715 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ERCC5P28715 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ERCC5P28715 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
ERCC5P28715 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ERCC5P28715 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ERCC5P28715 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ERCC5P28715 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ERCC5P28715 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ERCC5P28715 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ERCC5P28715 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ERCC5P28715 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ERCC5P28715 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ERCC5P28715 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ERCC5P28715 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ERCC5P28715 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ERCC5P28715 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ERCC5P28715 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ERCC5P28715 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ERCC5P28715 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ERCC5P28715 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ERCC5P28715 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ERCC5P28715 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ERCC5P28715 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ERCC5P28715 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ERCC5P28715 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ERCC5P28715 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ERCC5P28715 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ERCC5P28715 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ERCC5P28715 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ERCC5P28715 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ERCC5P28715 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ERCC5P28715 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ERCC5P28715 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ERCC5P28715 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ERCC5P28715 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ERCC5P28715 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ERCC5P28715 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
ERCC5P28715 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ERCC5P28715 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ERCC5P28715 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ERCC5P28715 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ERCC5P28715 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ERCC5P28715 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ERCC5P28715 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ERCC5P28715 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ERCC5P28715 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
ERCC5P28715 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ERCC5P28715 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ERCC5P28715 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ERCC5P28715 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
ERCC5P28715 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ERCC5P28715 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ERCC5P28715 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ERCC5P28715 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ERCC5P28715 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ERCC5P28715 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ERCC5P28715 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ERCC5P28715 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ERCC5P28715 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ERCC5P28715 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ERCC5P28715 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ERCC5P28715 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ERCC5P28715 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ERCC5P28715 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
ERCC5P28715 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ERCC5P28715 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ERCC5P28715 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ERCC5P28715 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ERCC5P28715 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ERCC5P28715 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ERCC5P28715 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ERCC5P28715 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ERCC5P28715 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
ERCC5P28715 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ERCC5P28715 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ERCC5P28715 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ERCC5P28715 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ERCC5P28715 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ERCC5P28715 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
ERCC5P28715 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ERCC5P28715 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ERCC5P28715 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ERCC5P28715 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
ERCC5P28715 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ERCC5P28715 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms