Protein–RNA interactions for Protein: P26583

HMGB2, High mobility group protein B2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB2P26583 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
HMGB2P26583 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
HMGB2P26583 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
HMGB2P26583 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
HMGB2P26583 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
HMGB2P26583 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
HMGB2P26583 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
HMGB2P26583 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
HMGB2P26583 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
HMGB2P26583 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
HMGB2P26583 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
HMGB2P26583 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
HMGB2P26583 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
HMGB2P26583 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
HMGB2P26583 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
HMGB2P26583 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
HMGB2P26583 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
HMGB2P26583 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
HMGB2P26583 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
HMGB2P26583 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
HMGB2P26583 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
HMGB2P26583 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
HMGB2P26583 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
HMGB2P26583 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
HMGB2P26583 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
HMGB2P26583 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
HMGB2P26583 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
HMGB2P26583 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
HMGB2P26583 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
HMGB2P26583 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
HMGB2P26583 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
HMGB2P26583 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
HMGB2P26583 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
HMGB2P26583 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
HMGB2P26583 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
HMGB2P26583 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
HMGB2P26583 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
HMGB2P26583 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
HMGB2P26583 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
HMGB2P26583 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
HMGB2P26583 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
HMGB2P26583 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
HMGB2P26583 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
HMGB2P26583 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
HMGB2P26583 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
HMGB2P26583 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
HMGB2P26583 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
HMGB2P26583 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
HMGB2P26583 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
HMGB2P26583 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
HMGB2P26583 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
HMGB2P26583 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
HMGB2P26583 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
HMGB2P26583 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
HMGB2P26583 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
HMGB2P26583 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
HMGB2P26583 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
HMGB2P26583 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
HMGB2P26583 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
HMGB2P26583 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
HMGB2P26583 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
HMGB2P26583 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
HMGB2P26583 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
HMGB2P26583 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
HMGB2P26583 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
HMGB2P26583 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
HMGB2P26583 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
HMGB2P26583 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC30.45■■■□□ 2.47
HMGB2P26583 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
HMGB2P26583 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
HMGB2P26583 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
HMGB2P26583 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
HMGB2P26583 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
HMGB2P26583 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
HMGB2P26583 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
HMGB2P26583 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC30.42■■■□□ 2.46
HMGB2P26583 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
HMGB2P26583 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
HMGB2P26583 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
HMGB2P26583 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
HMGB2P26583 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
HMGB2P26583 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
HMGB2P26583 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
HMGB2P26583 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
HMGB2P26583 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
HMGB2P26583 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
HMGB2P26583 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
HMGB2P26583 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
HMGB2P26583 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
HMGB2P26583 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
HMGB2P26583 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
HMGB2P26583 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
HMGB2P26583 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
HMGB2P26583 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
HMGB2P26583 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
HMGB2P26583 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
HMGB2P26583 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
HMGB2P26583 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
HMGB2P26583 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
HMGB2P26583 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms