Protein–RNA interactions for Protein: P24941

CDK2, Cyclin-dependent kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK2P24941 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDK2P24941 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDK2P24941 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDK2P24941 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CDK2P24941 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CDK2P24941 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CDK2P24941 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CDK2P24941 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CDK2P24941 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CDK2P24941 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CDK2P24941 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CDK2P24941 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CDK2P24941 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CDK2P24941 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDK2P24941 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDK2P24941 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CDK2P24941 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDK2P24941 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDK2P24941 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDK2P24941 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDK2P24941 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDK2P24941 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDK2P24941 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDK2P24941 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDK2P24941 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDK2P24941 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDK2P24941 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDK2P24941 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CDK2P24941 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDK2P24941 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDK2P24941 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDK2P24941 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDK2P24941 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDK2P24941 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDK2P24941 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDK2P24941 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDK2P24941 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDK2P24941 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDK2P24941 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDK2P24941 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDK2P24941 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDK2P24941 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDK2P24941 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDK2P24941 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDK2P24941 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CDK2P24941 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDK2P24941 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDK2P24941 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDK2P24941 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
CDK2P24941 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDK2P24941 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDK2P24941 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDK2P24941 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDK2P24941 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDK2P24941 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDK2P24941 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDK2P24941 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDK2P24941 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDK2P24941 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDK2P24941 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDK2P24941 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDK2P24941 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDK2P24941 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDK2P24941 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDK2P24941 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDK2P24941 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDK2P24941 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDK2P24941 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDK2P24941 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CDK2P24941 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDK2P24941 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDK2P24941 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDK2P24941 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDK2P24941 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDK2P24941 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDK2P24941 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDK2P24941 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDK2P24941 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDK2P24941 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDK2P24941 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDK2P24941 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDK2P24941 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDK2P24941 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDK2P24941 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDK2P24941 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDK2P24941 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDK2P24941 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDK2P24941 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDK2P24941 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDK2P24941 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDK2P24941 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDK2P24941 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDK2P24941 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDK2P24941 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDK2P24941 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDK2P24941 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDK2P24941 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDK2P24941 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK2P24941 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK2P24941 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms