Protein–RNA interactions for Protein: P23942

PRPH2, Peripherin-2, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPH2P23942 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRPH2P23942 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRPH2P23942 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRPH2P23942 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRPH2P23942 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRPH2P23942 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRPH2P23942 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRPH2P23942 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRPH2P23942 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRPH2P23942 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRPH2P23942 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRPH2P23942 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRPH2P23942 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRPH2P23942 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRPH2P23942 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRPH2P23942 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRPH2P23942 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRPH2P23942 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRPH2P23942 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRPH2P23942 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRPH2P23942 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRPH2P23942 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PRPH2P23942 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRPH2P23942 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRPH2P23942 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRPH2P23942 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRPH2P23942 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRPH2P23942 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRPH2P23942 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PRPH2P23942 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRPH2P23942 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRPH2P23942 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRPH2P23942 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRPH2P23942 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRPH2P23942 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRPH2P23942 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRPH2P23942 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRPH2P23942 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRPH2P23942 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRPH2P23942 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRPH2P23942 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRPH2P23942 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRPH2P23942 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRPH2P23942 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRPH2P23942 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRPH2P23942 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRPH2P23942 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PRPH2P23942 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PRPH2P23942 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRPH2P23942 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PRPH2P23942 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRPH2P23942 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRPH2P23942 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRPH2P23942 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRPH2P23942 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRPH2P23942 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRPH2P23942 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRPH2P23942 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRPH2P23942 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRPH2P23942 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRPH2P23942 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRPH2P23942 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRPH2P23942 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRPH2P23942 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRPH2P23942 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRPH2P23942 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRPH2P23942 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRPH2P23942 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRPH2P23942 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRPH2P23942 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PRPH2P23942 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRPH2P23942 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRPH2P23942 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRPH2P23942 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PRPH2P23942 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRPH2P23942 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRPH2P23942 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRPH2P23942 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRPH2P23942 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRPH2P23942 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PRPH2P23942 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRPH2P23942 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRPH2P23942 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRPH2P23942 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRPH2P23942 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRPH2P23942 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRPH2P23942 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRPH2P23942 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRPH2P23942 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRPH2P23942 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PRPH2P23942 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PRPH2P23942 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PRPH2P23942 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRPH2P23942 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRPH2P23942 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRPH2P23942 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRPH2P23942 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRPH2P23942 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRPH2P23942 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRPH2P23942 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms