Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
LMNB1P20700 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
LMNB1P20700 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
LMNB1P20700 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
LMNB1P20700 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
LMNB1P20700 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
LMNB1P20700 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
LMNB1P20700 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
LMNB1P20700 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
LMNB1P20700 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
LMNB1P20700 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
LMNB1P20700 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
LMNB1P20700 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
LMNB1P20700 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
LMNB1P20700 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
LMNB1P20700 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
LMNB1P20700 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
LMNB1P20700 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
LMNB1P20700 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
LMNB1P20700 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
LMNB1P20700 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
LMNB1P20700 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
LMNB1P20700 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
LMNB1P20700 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
LMNB1P20700 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
LMNB1P20700 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
LMNB1P20700 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
LMNB1P20700 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.28
LMNB1P20700 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
LMNB1P20700 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
LMNB1P20700 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC29.26■■■□□ 2.27
LMNB1P20700 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
LMNB1P20700 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
LMNB1P20700 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
LMNB1P20700 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
LMNB1P20700 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
LMNB1P20700 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
LMNB1P20700 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
LMNB1P20700 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
LMNB1P20700 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
LMNB1P20700 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
LMNB1P20700 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
LMNB1P20700 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
LMNB1P20700 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
LMNB1P20700 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
LMNB1P20700 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
LMNB1P20700 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
LMNB1P20700 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
LMNB1P20700 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
LMNB1P20700 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
LMNB1P20700 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
LMNB1P20700 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
LMNB1P20700 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
LMNB1P20700 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
LMNB1P20700 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
LMNB1P20700 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
LMNB1P20700 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
LMNB1P20700 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
LMNB1P20700 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
LMNB1P20700 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
LMNB1P20700 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
LMNB1P20700 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
LMNB1P20700 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
LMNB1P20700 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
LMNB1P20700 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC29.2■■■□□ 2.26
LMNB1P20700 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
LMNB1P20700 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
LMNB1P20700 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.19■■■□□ 2.26
LMNB1P20700 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
LMNB1P20700 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
LMNB1P20700 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
LMNB1P20700 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
LMNB1P20700 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
LMNB1P20700 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
LMNB1P20700 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
LMNB1P20700 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
LMNB1P20700 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
LMNB1P20700 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
LMNB1P20700 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
LMNB1P20700 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
LMNB1P20700 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
LMNB1P20700 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
LMNB1P20700 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
LMNB1P20700 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
LMNB1P20700 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
LMNB1P20700 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
LMNB1P20700 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
LMNB1P20700 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
LMNB1P20700 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
LMNB1P20700 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
LMNB1P20700 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
LMNB1P20700 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
LMNB1P20700 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
LMNB1P20700 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
LMNB1P20700 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
LMNB1P20700 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
LMNB1P20700 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
LMNB1P20700 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
LMNB1P20700 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
LMNB1P20700 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms