Protein–RNA interactions for Protein: P20336

RAB3A, Ras-related protein Rab-3A, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3AP20336 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAB3AP20336 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RAB3AP20336 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RAB3AP20336 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RAB3AP20336 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RAB3AP20336 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RAB3AP20336 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
RAB3AP20336 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RAB3AP20336 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RAB3AP20336 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RAB3AP20336 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
RAB3AP20336 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
RAB3AP20336 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
RAB3AP20336 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RAB3AP20336 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RAB3AP20336 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RAB3AP20336 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RAB3AP20336 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
RAB3AP20336 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RAB3AP20336 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RAB3AP20336 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RAB3AP20336 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RAB3AP20336 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RAB3AP20336 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAB3AP20336 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAB3AP20336 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAB3AP20336 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAB3AP20336 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAB3AP20336 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAB3AP20336 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAB3AP20336 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAB3AP20336 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAB3AP20336 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
RAB3AP20336 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAB3AP20336 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RAB3AP20336 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
RAB3AP20336 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RAB3AP20336 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RAB3AP20336 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RAB3AP20336 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RAB3AP20336 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RAB3AP20336 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RAB3AP20336 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB3AP20336 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB3AP20336 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB3AP20336 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB3AP20336 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB3AP20336 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB3AP20336 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB3AP20336 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB3AP20336 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB3AP20336 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB3AP20336 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB3AP20336 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB3AP20336 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB3AP20336 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB3AP20336 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB3AP20336 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB3AP20336 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB3AP20336 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB3AP20336 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB3AP20336 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB3AP20336 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB3AP20336 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB3AP20336 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB3AP20336 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB3AP20336 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB3AP20336 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB3AP20336 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB3AP20336 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB3AP20336 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
RAB3AP20336 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
RAB3AP20336 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB3AP20336 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB3AP20336 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB3AP20336 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB3AP20336 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB3AP20336 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB3AP20336 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB3AP20336 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB3AP20336 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB3AP20336 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB3AP20336 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB3AP20336 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB3AP20336 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB3AP20336 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB3AP20336 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB3AP20336 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB3AP20336 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB3AP20336 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB3AP20336 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB3AP20336 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB3AP20336 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB3AP20336 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB3AP20336 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB3AP20336 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB3AP20336 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB3AP20336 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB3AP20336 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB3AP20336 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms