Protein–RNA interactions for Protein: P19113

HDC, Histidine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDCP19113 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HDCP19113 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HDCP19113 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HDCP19113 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
HDCP19113 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HDCP19113 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HDCP19113 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HDCP19113 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HDCP19113 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HDCP19113 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HDCP19113 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
HDCP19113 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HDCP19113 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HDCP19113 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HDCP19113 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HDCP19113 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HDCP19113 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HDCP19113 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HDCP19113 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
HDCP19113 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HDCP19113 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HDCP19113 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HDCP19113 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HDCP19113 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HDCP19113 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HDCP19113 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HDCP19113 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HDCP19113 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HDCP19113 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HDCP19113 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HDCP19113 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HDCP19113 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HDCP19113 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HDCP19113 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
HDCP19113 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HDCP19113 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HDCP19113 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HDCP19113 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HDCP19113 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HDCP19113 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HDCP19113 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HDCP19113 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
HDCP19113 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HDCP19113 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HDCP19113 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HDCP19113 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HDCP19113 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HDCP19113 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.56
HDCP19113 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HDCP19113 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HDCP19113 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HDCP19113 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HDCP19113 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HDCP19113 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HDCP19113 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HDCP19113 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HDCP19113 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HDCP19113 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HDCP19113 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HDCP19113 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HDCP19113 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HDCP19113 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HDCP19113 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HDCP19113 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
HDCP19113 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HDCP19113 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HDCP19113 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HDCP19113 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HDCP19113 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HDCP19113 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HDCP19113 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HDCP19113 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HDCP19113 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HDCP19113 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HDCP19113 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HDCP19113 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HDCP19113 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HDCP19113 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HDCP19113 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
HDCP19113 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
HDCP19113 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HDCP19113 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HDCP19113 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HDCP19113 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HDCP19113 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
HDCP19113 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HDCP19113 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HDCP19113 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
HDCP19113 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
HDCP19113 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
HDCP19113 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
HDCP19113 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HDCP19113 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HDCP19113 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
HDCP19113 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HDCP19113 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HDCP19113 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HDCP19113 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HDCP19113 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HDCP19113 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms