Protein–RNA interactions for Protein: P17600

SYN1, Synapsin-1, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYN1P17600 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SYN1P17600 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SYN1P17600 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SYN1P17600 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SYN1P17600 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SYN1P17600 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SYN1P17600 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SYN1P17600 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SYN1P17600 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SYN1P17600 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SYN1P17600 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SYN1P17600 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SYN1P17600 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SYN1P17600 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SYN1P17600 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SYN1P17600 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SYN1P17600 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
SYN1P17600 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SYN1P17600 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SYN1P17600 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SYN1P17600 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SYN1P17600 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SYN1P17600 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SYN1P17600 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SYN1P17600 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SYN1P17600 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SYN1P17600 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SYN1P17600 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SYN1P17600 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
SYN1P17600 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
SYN1P17600 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
SYN1P17600 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SYN1P17600 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SYN1P17600 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SYN1P17600 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SYN1P17600 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SYN1P17600 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
SYN1P17600 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SYN1P17600 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SYN1P17600 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SYN1P17600 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SYN1P17600 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SYN1P17600 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
SYN1P17600 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SYN1P17600 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SYN1P17600 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SYN1P17600 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SYN1P17600 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SYN1P17600 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SYN1P17600 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SYN1P17600 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SYN1P17600 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SYN1P17600 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SYN1P17600 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
SYN1P17600 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SYN1P17600 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SYN1P17600 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SYN1P17600 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SYN1P17600 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SYN1P17600 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SYN1P17600 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SYN1P17600 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SYN1P17600 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SYN1P17600 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYN1P17600 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYN1P17600 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SYN1P17600 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYN1P17600 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYN1P17600 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYN1P17600 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYN1P17600 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SYN1P17600 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SYN1P17600 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYN1P17600 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SYN1P17600 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SYN1P17600 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SYN1P17600 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYN1P17600 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYN1P17600 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYN1P17600 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYN1P17600 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYN1P17600 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYN1P17600 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYN1P17600 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYN1P17600 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SYN1P17600 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYN1P17600 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYN1P17600 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SYN1P17600 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SYN1P17600 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SYN1P17600 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SYN1P17600 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYN1P17600 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYN1P17600 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYN1P17600 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYN1P17600 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYN1P17600 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYN1P17600 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYN1P17600 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYN1P17600 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms