Protein–RNA interactions for Protein: P17509

HOXB6, Homeobox protein Hox-B6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB6P17509 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXB6P17509 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXB6P17509 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXB6P17509 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXB6P17509 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXB6P17509 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXB6P17509 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXB6P17509 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXB6P17509 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXB6P17509 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXB6P17509 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXB6P17509 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXB6P17509 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXB6P17509 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXB6P17509 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXB6P17509 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXB6P17509 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXB6P17509 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXB6P17509 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXB6P17509 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXB6P17509 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXB6P17509 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXB6P17509 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXB6P17509 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXB6P17509 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXB6P17509 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXB6P17509 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXB6P17509 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXB6P17509 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXB6P17509 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXB6P17509 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXB6P17509 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXB6P17509 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXB6P17509 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXB6P17509 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXB6P17509 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HOXB6P17509 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOXB6P17509 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOXB6P17509 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOXB6P17509 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOXB6P17509 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HOXB6P17509 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOXB6P17509 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOXB6P17509 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOXB6P17509 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOXB6P17509 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXB6P17509 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXB6P17509 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXB6P17509 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXB6P17509 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXB6P17509 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXB6P17509 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXB6P17509 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXB6P17509 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXB6P17509 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXB6P17509 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXB6P17509 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXB6P17509 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXB6P17509 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXB6P17509 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXB6P17509 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXB6P17509 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXB6P17509 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXB6P17509 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXB6P17509 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXB6P17509 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXB6P17509 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXB6P17509 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXB6P17509 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXB6P17509 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXB6P17509 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXB6P17509 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXB6P17509 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXB6P17509 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXB6P17509 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXB6P17509 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXB6P17509 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXB6P17509 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXB6P17509 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXB6P17509 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXB6P17509 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXB6P17509 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXB6P17509 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXB6P17509 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXB6P17509 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXB6P17509 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXB6P17509 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXB6P17509 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXB6P17509 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXB6P17509 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXB6P17509 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXB6P17509 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXB6P17509 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXB6P17509 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXB6P17509 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXB6P17509 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXB6P17509 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXB6P17509 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXB6P17509 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXB6P17509 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms