Protein–RNA interactions for Protein: P16615

ATP2A2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A2P16615 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATP2A2P16615 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATP2A2P16615 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATP2A2P16615 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATP2A2P16615 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATP2A2P16615 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATP2A2P16615 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATP2A2P16615 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATP2A2P16615 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATP2A2P16615 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATP2A2P16615 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATP2A2P16615 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATP2A2P16615 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATP2A2P16615 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATP2A2P16615 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATP2A2P16615 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATP2A2P16615 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATP2A2P16615 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATP2A2P16615 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATP2A2P16615 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATP2A2P16615 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATP2A2P16615 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
ATP2A2P16615 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATP2A2P16615 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATP2A2P16615 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATP2A2P16615 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATP2A2P16615 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATP2A2P16615 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATP2A2P16615 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATP2A2P16615 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
ATP2A2P16615 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
ATP2A2P16615 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATP2A2P16615 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATP2A2P16615 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATP2A2P16615 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
ATP2A2P16615 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATP2A2P16615 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATP2A2P16615 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ATP2A2P16615 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
ATP2A2P16615 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATP2A2P16615 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATP2A2P16615 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATP2A2P16615 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATP2A2P16615 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATP2A2P16615 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATP2A2P16615 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATP2A2P16615 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATP2A2P16615 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATP2A2P16615 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATP2A2P16615 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATP2A2P16615 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATP2A2P16615 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATP2A2P16615 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATP2A2P16615 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATP2A2P16615 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATP2A2P16615 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATP2A2P16615 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATP2A2P16615 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATP2A2P16615 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATP2A2P16615 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATP2A2P16615 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATP2A2P16615 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATP2A2P16615 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
ATP2A2P16615 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
ATP2A2P16615 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATP2A2P16615 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATP2A2P16615 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATP2A2P16615 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
ATP2A2P16615 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATP2A2P16615 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATP2A2P16615 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
ATP2A2P16615 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATP2A2P16615 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATP2A2P16615 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATP2A2P16615 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATP2A2P16615 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATP2A2P16615 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATP2A2P16615 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATP2A2P16615 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATP2A2P16615 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATP2A2P16615 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATP2A2P16615 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATP2A2P16615 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATP2A2P16615 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATP2A2P16615 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATP2A2P16615 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
ATP2A2P16615 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP2A2P16615 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP2A2P16615 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP2A2P16615 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP2A2P16615 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP2A2P16615 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP2A2P16615 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP2A2P16615 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATP2A2P16615 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATP2A2P16615 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATP2A2P16615 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATP2A2P16615 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATP2A2P16615 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATP2A2P16615 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms