Protein–RNA interactions for Protein: P15172

MYOD1, Myoblast determination protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYOD1P15172 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MYOD1P15172 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MYOD1P15172 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MYOD1P15172 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MYOD1P15172 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
MYOD1P15172 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MYOD1P15172 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MYOD1P15172 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
MYOD1P15172 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MYOD1P15172 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
MYOD1P15172 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MYOD1P15172 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MYOD1P15172 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MYOD1P15172 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MYOD1P15172 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MYOD1P15172 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MYOD1P15172 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MYOD1P15172 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
MYOD1P15172 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MYOD1P15172 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MYOD1P15172 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MYOD1P15172 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MYOD1P15172 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MYOD1P15172 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MYOD1P15172 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MYOD1P15172 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MYOD1P15172 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MYOD1P15172 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
MYOD1P15172 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MYOD1P15172 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MYOD1P15172 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MYOD1P15172 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MYOD1P15172 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MYOD1P15172 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MYOD1P15172 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MYOD1P15172 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MYOD1P15172 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MYOD1P15172 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MYOD1P15172 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MYOD1P15172 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MYOD1P15172 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MYOD1P15172 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MYOD1P15172 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MYOD1P15172 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
MYOD1P15172 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MYOD1P15172 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MYOD1P15172 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MYOD1P15172 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MYOD1P15172 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MYOD1P15172 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MYOD1P15172 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MYOD1P15172 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MYOD1P15172 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MYOD1P15172 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MYOD1P15172 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
MYOD1P15172 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MYOD1P15172 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MYOD1P15172 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MYOD1P15172 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MYOD1P15172 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MYOD1P15172 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MYOD1P15172 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MYOD1P15172 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MYOD1P15172 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MYOD1P15172 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MYOD1P15172 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
MYOD1P15172 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MYOD1P15172 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MYOD1P15172 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MYOD1P15172 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MYOD1P15172 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MYOD1P15172 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MYOD1P15172 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MYOD1P15172 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MYOD1P15172 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MYOD1P15172 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MYOD1P15172 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
MYOD1P15172 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MYOD1P15172 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MYOD1P15172 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MYOD1P15172 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MYOD1P15172 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MYOD1P15172 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MYOD1P15172 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MYOD1P15172 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MYOD1P15172 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MYOD1P15172 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MYOD1P15172 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MYOD1P15172 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MYOD1P15172 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
MYOD1P15172 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MYOD1P15172 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MYOD1P15172 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MYOD1P15172 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MYOD1P15172 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MYOD1P15172 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MYOD1P15172 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MYOD1P15172 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MYOD1P15172 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MYOD1P15172 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms