Protein–RNA interactions for Protein: P13349

MYF5, Myogenic factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYF5P13349 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MYF5P13349 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MYF5P13349 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MYF5P13349 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MYF5P13349 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MYF5P13349 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MYF5P13349 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MYF5P13349 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
MYF5P13349 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MYF5P13349 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MYF5P13349 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MYF5P13349 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MYF5P13349 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MYF5P13349 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MYF5P13349 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MYF5P13349 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MYF5P13349 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MYF5P13349 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MYF5P13349 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MYF5P13349 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MYF5P13349 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MYF5P13349 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MYF5P13349 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MYF5P13349 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MYF5P13349 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MYF5P13349 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MYF5P13349 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MYF5P13349 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
MYF5P13349 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MYF5P13349 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MYF5P13349 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MYF5P13349 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MYF5P13349 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MYF5P13349 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MYF5P13349 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MYF5P13349 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MYF5P13349 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MYF5P13349 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MYF5P13349 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MYF5P13349 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
MYF5P13349 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MYF5P13349 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
MYF5P13349 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MYF5P13349 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MYF5P13349 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MYF5P13349 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MYF5P13349 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MYF5P13349 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MYF5P13349 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MYF5P13349 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MYF5P13349 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MYF5P13349 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MYF5P13349 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MYF5P13349 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MYF5P13349 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MYF5P13349 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MYF5P13349 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MYF5P13349 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MYF5P13349 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MYF5P13349 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MYF5P13349 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MYF5P13349 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MYF5P13349 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MYF5P13349 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MYF5P13349 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MYF5P13349 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
MYF5P13349 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MYF5P13349 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MYF5P13349 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MYF5P13349 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MYF5P13349 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MYF5P13349 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MYF5P13349 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
MYF5P13349 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MYF5P13349 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MYF5P13349 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MYF5P13349 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MYF5P13349 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MYF5P13349 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MYF5P13349 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MYF5P13349 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MYF5P13349 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MYF5P13349 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MYF5P13349 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MYF5P13349 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MYF5P13349 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MYF5P13349 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MYF5P13349 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MYF5P13349 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MYF5P13349 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MYF5P13349 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MYF5P13349 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MYF5P13349 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MYF5P13349 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
MYF5P13349 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
MYF5P13349 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MYF5P13349 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MYF5P13349 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MYF5P13349 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MYF5P13349 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.1 ms