Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GP1BBP13224 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GP1BBP13224 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GP1BBP13224 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GP1BBP13224 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GP1BBP13224 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GP1BBP13224 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GP1BBP13224 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GP1BBP13224 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GP1BBP13224 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GP1BBP13224 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GP1BBP13224 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GP1BBP13224 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GP1BBP13224 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GP1BBP13224 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GP1BBP13224 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GP1BBP13224 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GP1BBP13224 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GP1BBP13224 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GP1BBP13224 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GP1BBP13224 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GP1BBP13224 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GP1BBP13224 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GP1BBP13224 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GP1BBP13224 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GP1BBP13224 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GP1BBP13224 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GP1BBP13224 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GP1BBP13224 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GP1BBP13224 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GP1BBP13224 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GP1BBP13224 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GP1BBP13224 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GP1BBP13224 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GP1BBP13224 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GP1BBP13224 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GP1BBP13224 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GP1BBP13224 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GP1BBP13224 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GP1BBP13224 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
GP1BBP13224 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GP1BBP13224 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GP1BBP13224 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GP1BBP13224 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GP1BBP13224 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GP1BBP13224 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GP1BBP13224 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GP1BBP13224 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GP1BBP13224 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GP1BBP13224 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GP1BBP13224 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GP1BBP13224 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GP1BBP13224 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GP1BBP13224 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GP1BBP13224 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GP1BBP13224 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GP1BBP13224 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GP1BBP13224 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GP1BBP13224 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GP1BBP13224 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GP1BBP13224 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GP1BBP13224 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GP1BBP13224 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GP1BBP13224 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GP1BBP13224 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GP1BBP13224 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GP1BBP13224 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GP1BBP13224 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GP1BBP13224 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GP1BBP13224 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GP1BBP13224 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GP1BBP13224 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GP1BBP13224 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GP1BBP13224 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GP1BBP13224 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GP1BBP13224 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GP1BBP13224 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GP1BBP13224 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GP1BBP13224 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GP1BBP13224 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GP1BBP13224 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GP1BBP13224 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GP1BBP13224 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GP1BBP13224 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GP1BBP13224 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GP1BBP13224 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GP1BBP13224 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GP1BBP13224 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GP1BBP13224 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GP1BBP13224 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GP1BBP13224 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GP1BBP13224 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GP1BBP13224 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GP1BBP13224 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GP1BBP13224 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GP1BBP13224 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GP1BBP13224 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GP1BBP13224 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GP1BBP13224 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GP1BBP13224 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms