Protein–RNA interactions for Protein: P12830

CDH1, Cadherin-1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH1P12830 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDH1P12830 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDH1P12830 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDH1P12830 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDH1P12830 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDH1P12830 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDH1P12830 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDH1P12830 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDH1P12830 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDH1P12830 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDH1P12830 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDH1P12830 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDH1P12830 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDH1P12830 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDH1P12830 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDH1P12830 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDH1P12830 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CDH1P12830 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDH1P12830 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDH1P12830 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDH1P12830 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDH1P12830 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDH1P12830 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CDH1P12830 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDH1P12830 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDH1P12830 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDH1P12830 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDH1P12830 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDH1P12830 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDH1P12830 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDH1P12830 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CDH1P12830 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDH1P12830 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDH1P12830 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDH1P12830 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDH1P12830 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CDH1P12830 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDH1P12830 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDH1P12830 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDH1P12830 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDH1P12830 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDH1P12830 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDH1P12830 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CDH1P12830 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CDH1P12830 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDH1P12830 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDH1P12830 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDH1P12830 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDH1P12830 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDH1P12830 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDH1P12830 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDH1P12830 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDH1P12830 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDH1P12830 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDH1P12830 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDH1P12830 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CDH1P12830 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDH1P12830 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDH1P12830 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDH1P12830 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDH1P12830 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDH1P12830 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDH1P12830 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDH1P12830 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDH1P12830 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH1P12830 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH1P12830 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH1P12830 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH1P12830 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH1P12830 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH1P12830 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH1P12830 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH1P12830 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH1P12830 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CDH1P12830 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDH1P12830 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDH1P12830 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CDH1P12830 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDH1P12830 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH1P12830 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH1P12830 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH1P12830 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH1P12830 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH1P12830 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH1P12830 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH1P12830 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH1P12830 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH1P12830 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDH1P12830 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDH1P12830 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDH1P12830 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CDH1P12830 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDH1P12830 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDH1P12830 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDH1P12830 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDH1P12830 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDH1P12830 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDH1P12830 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDH1P12830 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDH1P12830 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78 ms