Protein–RNA interactions for Protein: P11802

CDK4, Cyclin-dependent kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK4P11802 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDK4P11802 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDK4P11802 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDK4P11802 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CDK4P11802 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDK4P11802 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDK4P11802 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDK4P11802 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDK4P11802 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDK4P11802 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDK4P11802 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDK4P11802 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDK4P11802 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDK4P11802 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDK4P11802 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDK4P11802 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDK4P11802 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDK4P11802 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDK4P11802 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDK4P11802 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDK4P11802 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDK4P11802 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDK4P11802 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDK4P11802 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDK4P11802 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDK4P11802 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDK4P11802 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CDK4P11802 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CDK4P11802 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDK4P11802 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDK4P11802 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK4P11802 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK4P11802 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK4P11802 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK4P11802 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK4P11802 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK4P11802 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK4P11802 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK4P11802 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK4P11802 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK4P11802 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK4P11802 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK4P11802 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK4P11802 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK4P11802 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK4P11802 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK4P11802 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK4P11802 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK4P11802 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDK4P11802 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDK4P11802 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDK4P11802 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDK4P11802 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDK4P11802 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDK4P11802 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDK4P11802 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDK4P11802 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDK4P11802 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDK4P11802 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK4P11802 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK4P11802 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK4P11802 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK4P11802 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK4P11802 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK4P11802 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK4P11802 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK4P11802 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK4P11802 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDK4P11802 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDK4P11802 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDK4P11802 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CDK4P11802 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDK4P11802 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDK4P11802 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDK4P11802 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDK4P11802 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK4P11802 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK4P11802 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK4P11802 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDK4P11802 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDK4P11802 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK4P11802 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK4P11802 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK4P11802 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK4P11802 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK4P11802 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK4P11802 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK4P11802 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK4P11802 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK4P11802 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK4P11802 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK4P11802 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK4P11802 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK4P11802 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK4P11802 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK4P11802 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK4P11802 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK4P11802 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK4P11802 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDK4P11802 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms