Protein–RNA interactions for Protein: P11279

LAMP1, Lysosome-associated membrane glycoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMP1P11279 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LAMP1P11279 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LAMP1P11279 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LAMP1P11279 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LAMP1P11279 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LAMP1P11279 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LAMP1P11279 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LAMP1P11279 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LAMP1P11279 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LAMP1P11279 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LAMP1P11279 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LAMP1P11279 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LAMP1P11279 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LAMP1P11279 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
LAMP1P11279 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LAMP1P11279 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
LAMP1P11279 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LAMP1P11279 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LAMP1P11279 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LAMP1P11279 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LAMP1P11279 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LAMP1P11279 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LAMP1P11279 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LAMP1P11279 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LAMP1P11279 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LAMP1P11279 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LAMP1P11279 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LAMP1P11279 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LAMP1P11279 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LAMP1P11279 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LAMP1P11279 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LAMP1P11279 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LAMP1P11279 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LAMP1P11279 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LAMP1P11279 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LAMP1P11279 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LAMP1P11279 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LAMP1P11279 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LAMP1P11279 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
LAMP1P11279 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LAMP1P11279 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LAMP1P11279 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LAMP1P11279 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LAMP1P11279 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LAMP1P11279 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LAMP1P11279 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LAMP1P11279 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LAMP1P11279 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LAMP1P11279 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LAMP1P11279 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LAMP1P11279 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LAMP1P11279 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LAMP1P11279 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LAMP1P11279 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LAMP1P11279 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
LAMP1P11279 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LAMP1P11279 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LAMP1P11279 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LAMP1P11279 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LAMP1P11279 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LAMP1P11279 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LAMP1P11279 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LAMP1P11279 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LAMP1P11279 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LAMP1P11279 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LAMP1P11279 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LAMP1P11279 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LAMP1P11279 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LAMP1P11279 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LAMP1P11279 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LAMP1P11279 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LAMP1P11279 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LAMP1P11279 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LAMP1P11279 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
LAMP1P11279 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LAMP1P11279 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LAMP1P11279 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LAMP1P11279 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LAMP1P11279 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LAMP1P11279 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LAMP1P11279 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LAMP1P11279 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LAMP1P11279 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LAMP1P11279 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LAMP1P11279 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LAMP1P11279 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LAMP1P11279 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LAMP1P11279 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LAMP1P11279 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LAMP1P11279 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LAMP1P11279 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LAMP1P11279 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LAMP1P11279 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LAMP1P11279 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LAMP1P11279 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LAMP1P11279 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LAMP1P11279 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LAMP1P11279 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LAMP1P11279 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LAMP1P11279 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms