Protein–RNA interactions for Protein: P0DMW4

SMIM10L2A, Small integral membrane protein 10-like protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM10L2AP0DMW4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMIM10L2AP0DMW4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMIM10L2AP0DMW4 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMIM10L2AP0DMW4 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SMIM10L2AP0DMW4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMIM10L2AP0DMW4 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMIM10L2AP0DMW4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMIM10L2AP0DMW4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMIM10L2AP0DMW4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMIM10L2AP0DMW4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMIM10L2AP0DMW4 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMIM10L2AP0DMW4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMIM10L2AP0DMW4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMIM10L2AP0DMW4 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
SMIM10L2AP0DMW4 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
SMIM10L2AP0DMW4 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMIM10L2AP0DMW4 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMIM10L2AP0DMW4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMIM10L2AP0DMW4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMIM10L2AP0DMW4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMIM10L2AP0DMW4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMIM10L2AP0DMW4 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMIM10L2AP0DMW4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SMIM10L2AP0DMW4 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SMIM10L2AP0DMW4 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SMIM10L2AP0DMW4 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SMIM10L2AP0DMW4 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SMIM10L2AP0DMW4 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SMIM10L2AP0DMW4 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SMIM10L2AP0DMW4 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SMIM10L2AP0DMW4 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SMIM10L2AP0DMW4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SMIM10L2AP0DMW4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SMIM10L2AP0DMW4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SMIM10L2AP0DMW4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SMIM10L2AP0DMW4 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SMIM10L2AP0DMW4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SMIM10L2AP0DMW4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SMIM10L2AP0DMW4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMIM10L2AP0DMW4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMIM10L2AP0DMW4 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
SMIM10L2AP0DMW4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMIM10L2AP0DMW4 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMIM10L2AP0DMW4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
SMIM10L2AP0DMW4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMIM10L2AP0DMW4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMIM10L2AP0DMW4 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMIM10L2AP0DMW4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMIM10L2AP0DMW4 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SMIM10L2AP0DMW4 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SMIM10L2AP0DMW4 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SMIM10L2AP0DMW4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SMIM10L2AP0DMW4 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SMIM10L2AP0DMW4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SMIM10L2AP0DMW4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SMIM10L2AP0DMW4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SMIM10L2AP0DMW4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SMIM10L2AP0DMW4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SMIM10L2AP0DMW4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SMIM10L2AP0DMW4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SMIM10L2AP0DMW4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SMIM10L2AP0DMW4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SMIM10L2AP0DMW4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SMIM10L2AP0DMW4 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SMIM10L2AP0DMW4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SMIM10L2AP0DMW4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SMIM10L2AP0DMW4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SMIM10L2AP0DMW4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SMIM10L2AP0DMW4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SMIM10L2AP0DMW4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SMIM10L2AP0DMW4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SMIM10L2AP0DMW4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SMIM10L2AP0DMW4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SMIM10L2AP0DMW4 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SMIM10L2AP0DMW4 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SMIM10L2AP0DMW4 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
SMIM10L2AP0DMW4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SMIM10L2AP0DMW4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SMIM10L2AP0DMW4 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SMIM10L2AP0DMW4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SMIM10L2AP0DMW4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SMIM10L2AP0DMW4 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SMIM10L2AP0DMW4 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SMIM10L2AP0DMW4 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SMIM10L2AP0DMW4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SMIM10L2AP0DMW4 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SMIM10L2AP0DMW4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SMIM10L2AP0DMW4 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SMIM10L2AP0DMW4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SMIM10L2AP0DMW4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SMIM10L2AP0DMW4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SMIM10L2AP0DMW4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SMIM10L2AP0DMW4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SMIM10L2AP0DMW4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SMIM10L2AP0DMW4 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SMIM10L2AP0DMW4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SMIM10L2AP0DMW4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SMIM10L2AP0DMW4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SMIM10L2AP0DMW4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SMIM10L2AP0DMW4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms