Protein–RNA interactions for Protein: P0DML3

CSH2, Chorionic somatomammotropin hormone 2, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSH2P0DML3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CSH2P0DML3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CSH2P0DML3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CSH2P0DML3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CSH2P0DML3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CSH2P0DML3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CSH2P0DML3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CSH2P0DML3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CSH2P0DML3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CSH2P0DML3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CSH2P0DML3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CSH2P0DML3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CSH2P0DML3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CSH2P0DML3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CSH2P0DML3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CSH2P0DML3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CSH2P0DML3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CSH2P0DML3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CSH2P0DML3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CSH2P0DML3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CSH2P0DML3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CSH2P0DML3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CSH2P0DML3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CSH2P0DML3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CSH2P0DML3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CSH2P0DML3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CSH2P0DML3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CSH2P0DML3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CSH2P0DML3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CSH2P0DML3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CSH2P0DML3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CSH2P0DML3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CSH2P0DML3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CSH2P0DML3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CSH2P0DML3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CSH2P0DML3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CSH2P0DML3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CSH2P0DML3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CSH2P0DML3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CSH2P0DML3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CSH2P0DML3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CSH2P0DML3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CSH2P0DML3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CSH2P0DML3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CSH2P0DML3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CSH2P0DML3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CSH2P0DML3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CSH2P0DML3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CSH2P0DML3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CSH2P0DML3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CSH2P0DML3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CSH2P0DML3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CSH2P0DML3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CSH2P0DML3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CSH2P0DML3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CSH2P0DML3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CSH2P0DML3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CSH2P0DML3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CSH2P0DML3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CSH2P0DML3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CSH2P0DML3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CSH2P0DML3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CSH2P0DML3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CSH2P0DML3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CSH2P0DML3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CSH2P0DML3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CSH2P0DML3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CSH2P0DML3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CSH2P0DML3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CSH2P0DML3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CSH2P0DML3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CSH2P0DML3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CSH2P0DML3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CSH2P0DML3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CSH2P0DML3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CSH2P0DML3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CSH2P0DML3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CSH2P0DML3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CSH2P0DML3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CSH2P0DML3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CSH2P0DML3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CSH2P0DML3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CSH2P0DML3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CSH2P0DML3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CSH2P0DML3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CSH2P0DML3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CSH2P0DML3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CSH2P0DML3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CSH2P0DML3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CSH2P0DML3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CSH2P0DML3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CSH2P0DML3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CSH2P0DML3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CSH2P0DML3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CSH2P0DML3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CSH2P0DML3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CSH2P0DML3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CSH2P0DML3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CSH2P0DML3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CSH2P0DML3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms