Protein–RNA interactions for Protein: P0C860

MSL3P1, Putative male-specific lethal-3 protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSL3P1P0C860 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MSL3P1P0C860 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MSL3P1P0C860 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MSL3P1P0C860 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MSL3P1P0C860 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MSL3P1P0C860 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MSL3P1P0C860 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MSL3P1P0C860 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MSL3P1P0C860 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MSL3P1P0C860 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MSL3P1P0C860 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MSL3P1P0C860 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MSL3P1P0C860 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MSL3P1P0C860 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MSL3P1P0C860 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MSL3P1P0C860 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MSL3P1P0C860 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MSL3P1P0C860 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MSL3P1P0C860 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MSL3P1P0C860 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MSL3P1P0C860 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MSL3P1P0C860 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MSL3P1P0C860 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MSL3P1P0C860 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MSL3P1P0C860 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MSL3P1P0C860 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MSL3P1P0C860 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MSL3P1P0C860 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MSL3P1P0C860 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MSL3P1P0C860 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MSL3P1P0C860 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MSL3P1P0C860 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MSL3P1P0C860 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MSL3P1P0C860 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MSL3P1P0C860 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MSL3P1P0C860 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MSL3P1P0C860 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MSL3P1P0C860 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MSL3P1P0C860 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MSL3P1P0C860 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MSL3P1P0C860 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MSL3P1P0C860 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MSL3P1P0C860 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MSL3P1P0C860 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MSL3P1P0C860 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MSL3P1P0C860 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MSL3P1P0C860 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MSL3P1P0C860 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MSL3P1P0C860 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MSL3P1P0C860 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MSL3P1P0C860 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MSL3P1P0C860 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MSL3P1P0C860 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MSL3P1P0C860 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MSL3P1P0C860 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MSL3P1P0C860 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MSL3P1P0C860 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MSL3P1P0C860 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MSL3P1P0C860 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MSL3P1P0C860 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MSL3P1P0C860 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MSL3P1P0C860 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MSL3P1P0C860 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MSL3P1P0C860 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MSL3P1P0C860 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MSL3P1P0C860 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MSL3P1P0C860 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MSL3P1P0C860 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MSL3P1P0C860 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MSL3P1P0C860 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MSL3P1P0C860 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MSL3P1P0C860 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MSL3P1P0C860 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MSL3P1P0C860 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MSL3P1P0C860 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MSL3P1P0C860 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MSL3P1P0C860 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MSL3P1P0C860 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MSL3P1P0C860 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MSL3P1P0C860 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MSL3P1P0C860 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MSL3P1P0C860 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MSL3P1P0C860 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MSL3P1P0C860 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MSL3P1P0C860 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MSL3P1P0C860 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MSL3P1P0C860 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MSL3P1P0C860 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MSL3P1P0C860 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MSL3P1P0C860 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MSL3P1P0C860 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MSL3P1P0C860 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MSL3P1P0C860 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MSL3P1P0C860 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MSL3P1P0C860 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MSL3P1P0C860 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MSL3P1P0C860 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MSL3P1P0C860 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MSL3P1P0C860 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MSL3P1P0C860 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms