Protein–RNA interactions for Protein: P07437

TUBB, Tubulin beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBBP07437 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TUBBP07437 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TUBBP07437 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TUBBP07437 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TUBBP07437 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TUBBP07437 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TUBBP07437 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TUBBP07437 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TUBBP07437 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TUBBP07437 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TUBBP07437 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TUBBP07437 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TUBBP07437 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TUBBP07437 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TUBBP07437 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TUBBP07437 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TUBBP07437 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TUBBP07437 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TUBBP07437 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TUBBP07437 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TUBBP07437 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TUBBP07437 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TUBBP07437 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TUBBP07437 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TUBBP07437 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TUBBP07437 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TUBBP07437 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TUBBP07437 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TUBBP07437 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TUBBP07437 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TUBBP07437 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TUBBP07437 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TUBBP07437 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TUBBP07437 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TUBBP07437 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TUBBP07437 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TUBBP07437 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TUBBP07437 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TUBBP07437 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TUBBP07437 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TUBBP07437 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TUBBP07437 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TUBBP07437 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TUBBP07437 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TUBBP07437 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TUBBP07437 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TUBBP07437 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TUBBP07437 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TUBBP07437 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TUBBP07437 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TUBBP07437 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TUBBP07437 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TUBBP07437 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TUBBP07437 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TUBBP07437 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TUBBP07437 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TUBBP07437 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TUBBP07437 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TUBBP07437 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TUBBP07437 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TUBBP07437 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TUBBP07437 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TUBBP07437 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TUBBP07437 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TUBBP07437 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TUBBP07437 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TUBBP07437 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TUBBP07437 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TUBBP07437 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TUBBP07437 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TUBBP07437 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TUBBP07437 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TUBBP07437 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TUBBP07437 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TUBBP07437 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TUBBP07437 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TUBBP07437 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TUBBP07437 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TUBBP07437 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TUBBP07437 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TUBBP07437 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TUBBP07437 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TUBBP07437 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TUBBP07437 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TUBBP07437 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TUBBP07437 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TUBBP07437 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TUBBP07437 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TUBBP07437 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TUBBP07437 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TUBBP07437 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TUBBP07437 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TUBBP07437 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TUBBP07437 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TUBBP07437 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TUBBP07437 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TUBBP07437 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TUBBP07437 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TUBBP07437 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TUBBP07437 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms