Protein–RNA interactions for Protein: P05556

ITGB1, Integrin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB1P05556 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ITGB1P05556 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ITGB1P05556 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ITGB1P05556 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ITGB1P05556 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ITGB1P05556 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ITGB1P05556 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ITGB1P05556 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ITGB1P05556 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ITGB1P05556 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ITGB1P05556 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ITGB1P05556 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ITGB1P05556 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ITGB1P05556 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ITGB1P05556 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ITGB1P05556 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ITGB1P05556 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ITGB1P05556 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ITGB1P05556 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ITGB1P05556 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ITGB1P05556 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
ITGB1P05556 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ITGB1P05556 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ITGB1P05556 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ITGB1P05556 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ITGB1P05556 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ITGB1P05556 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ITGB1P05556 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ITGB1P05556 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ITGB1P05556 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ITGB1P05556 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ITGB1P05556 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ITGB1P05556 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ITGB1P05556 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
ITGB1P05556 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ITGB1P05556 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ITGB1P05556 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ITGB1P05556 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ITGB1P05556 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ITGB1P05556 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ITGB1P05556 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ITGB1P05556 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ITGB1P05556 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ITGB1P05556 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ITGB1P05556 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ITGB1P05556 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ITGB1P05556 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITGB1P05556 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITGB1P05556 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITGB1P05556 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITGB1P05556 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITGB1P05556 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITGB1P05556 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ITGB1P05556 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITGB1P05556 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITGB1P05556 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ITGB1P05556 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ITGB1P05556 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ITGB1P05556 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ITGB1P05556 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ITGB1P05556 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ITGB1P05556 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ITGB1P05556 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ITGB1P05556 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ITGB1P05556 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ITGB1P05556 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ITGB1P05556 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ITGB1P05556 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
ITGB1P05556 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ITGB1P05556 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITGB1P05556 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITGB1P05556 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITGB1P05556 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITGB1P05556 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITGB1P05556 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITGB1P05556 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITGB1P05556 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITGB1P05556 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITGB1P05556 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITGB1P05556 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITGB1P05556 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITGB1P05556 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ITGB1P05556 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ITGB1P05556 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ITGB1P05556 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ITGB1P05556 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ITGB1P05556 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ITGB1P05556 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ITGB1P05556 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ITGB1P05556 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
ITGB1P05556 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ITGB1P05556 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ITGB1P05556 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ITGB1P05556 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ITGB1P05556 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ITGB1P05556 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ITGB1P05556 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ITGB1P05556 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ITGB1P05556 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ITGB1P05556 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms